Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0059200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0653
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:39901434-39902039 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39435762-39436367 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-141.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -153.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((.((((.(((......)))..))))..(((((((.........(((((((.((((.((((.....(((((((.(((...))).))))).)).....)))).))))))).))))))))))).........(((..................)))......)))))))..)))).....((((.(((..((((((..((((((((....((((((((((((.((.((.((....(((.....)))..)).)).)).))))))))))))(((((((...............))))))).((((...))))....(((((((((...........).))))))))(((((.((((.(((.........))))))).)))))))))))))))))))......(((.(((((((((((....((((..(((((...((((.........((((.((((((..((((((((((((....((((....(((((..........)))))))))..)))).)))).)).....))..)))))).)))).........)))))))))..))))....))))))))))).))).....))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((.((((,,..,|||},||},.,.,|||,.||||..(((((((,........{((((((.((((.((((.....(((((((.(((...))).))))).)).,...)))).))))))).)))))))))))...,....{{{..,.{{{.,,........,,,))}.,}.))),,,,.}))))}}.,.||{{.{((..((((((..((((((((....{(((((((((((.((.,(,((....(((.....)))..)).)).)).)))))))))))}(((((((...............))))))}.((((...))))...,(((((((({...........)}})))))))|((((.((((.(((.........))))))).))))}))))))))))))))......(((.(((((((((((....((((..(((((,.{((((.......,.((((.((((((..{((((((({,{{.{{|((({....{({{{.....,,.,.,}))))))).,))}).)))),,}.....,}..)))))).)))).........)))))))))..))))....))))))))))).))).....))).}}},
Forensic Context

No forensic context available.