Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0059300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0191
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:39901945-39910507 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39436273-39444835 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-508.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -544.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 421.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.........(.((..(((((((..((((.(((.(..((.....))..).)))..))))...)))))))..)).).........)))(.(((..((((((((..(....(((..((((((((((..((..((((..(..((.....))..).........))))..)))))))))))))))..(((((((((((.((((.....((((((.(((((((((((........((.((.(((((.((.((....(((((...)))))..)).)).))))).)))).(((((((.(((.((((..(.....)..))))..)).).))))))).....((((((((((...((.(((((((....((((.....(((((.((((((...((((.((.......)).))))...))....))))))))))))).......))))))).))......((((((......))))))....))))))))))(((((((((((((((..((((..(....)..))))............)))))))))).....((.((((.....)))).))(((..((((((.....))).)))...)))......))))).......((((((..(((..((((((((((((((.((..(((((((..((((..(((.((.....(((..((((((((............)))))))))))....)).)))..))))..((((.(((..((.(((((.......)))))))..)))....))))....(((......)))........))))).)).)).)))))))))))....)))...)))..))))))......((((((((...(.((((..((((.(((((((((((..(((((.((((((..(((((..(((((((((((((((.........(((((((......(((((...(((((.......(((.((((((((((..((((........))))....))).......((((((.......((((((.(((.((......))...)))..))))))......((((((....(((((((.......(((.(....))).).......))))))).......))).)))...)))))).......(((((......(((((((.(........)))))..)))......)))))(((((((.....)))))))))))))).))))))))...)))))......(((((((....)))))))......((((........)))).....(((.....))).(((......))).((((...(((((...(((((((.(((..........))).))))))))))))))))..)))))))....))))))).(((((((((((((.(((((((((......((((((........))))))..)))))))))))))((((((((.((..(((((((((.....)))))))........(((((..((.(((((....)))))..))..))))).....))..)).)))))))).(((((..((.((((.....)))).))..)))))..........)))))))))..))))...))))...)))))....)))))).)))))..))...))))))).......(((((..((((..(((..(((...)))...)))))))..))))).((((....))))))..))))..)))).).)))).)))))))).)))))))))))))(((((((.........(((((...))))))))))))....))))..))))))))))))..))))))..))..))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...{{{{{.{.,{..((((,{,.....,}}}}.|..,,}.}}})}....,||..,|.|{{{|,,.,,,..))})}.....,..)))(.(((..((((((((..,....(((..((((((((((..((..((((..{..((.....}}....,.......))))..)))))))))))),},,}|((((((((((.((((.....((((({.(((((((((((........{(.((.(((((.((.((....(((({...})))),.)).)).))))).)))}.((((((({{((.((((..{.....,..)))).,}).).))))))).....,{((((((((..{(.,.((((({,....((((((((((((({{,{,((({{(,((,((...,{{.,,.,)))...)).},.}})))))).,}....})))},,))))))))......((((((......))))))....,}}}}}|||{(((((((((((((((.,((((..(....)..))))...........,))))))))))}....||,{||||...}))))}),}.}}.||||||}}}|{|||.,,.............,,)))),..,,.((((((..(((..((((((((((((((.((..((({((({{{{{(..(((,({...,{(,({.((,(({{,.{({..{{{,|,||,|||||||,{.{{||.|||{{,,...}}|}}.|||}},|.|||||}},,.}}))),))),.}}),...)),}}.,}|||....,.}}}........))))).)).)).)))))))))))....)))...)))..))))))......((((((((...{.((((..((((.{,(((((((((..(((((.((((((..(((((..(((({((({((((((.........(((((((......((((({,.,.|||....{(((((.((((((((({..((((........))))....))}..{{,,.,,,|||,......{(((((.(((.{,.....,}}.,.)))..))))))..|{.{(((((({..,{((((((.......,{{.{{,.,|}}.|.....,.},)}))}....,,..,,.}}},,.,,,}))...}}}},||||,.....,(((((((.....)))))))....,,,......,,..,((((((,.....)))))))))))))).)))))),},{{||,})|..,,.,((((((,{{.|||||,,......))))}}}}}...))))|,,|.{|,.,...|||.{{{,,,...))).|||{...(((((...(((((((.(((..........))).))))))))))))})}}..)))))))....))))))},|((((((((((((.(((((((((.....,((((((........)))))).,)))))))))))))((((((((.((..((..(((((,,,,{|.,||||.......,||{{{..((.(((((....)))))..))..))))})))))))..)).)))))))).{{{{,..{|,||||.,{{{||||{|,..|},}},|...|,||,)))))))))..,}}}...))))...))))),...)))))).)))))..))...))))))).......{{{{{..{(((.,(((..(((...)))...))))}))..}}}},.{((,....}))),,..))))..)))).}.)))),,))))))).)))))))})))))((((((({,......,,{{{|...)}})))))))))....))))..))))))))))})..))))))..))..))).)
Forensic Context

No forensic context available.