Basic Information

Symbol
hsa_MACF1_0060700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0179
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:39904663-39905372 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39438991-39439700 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-239.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -253.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 148.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...)))....)(((((((((.((((((((((((((.((((((((.((((.((((((((((((((((..(((((((((((((((((.((.............................((((...)))).......(((((((..(((((....((((((...))))))..)))))..))))))).........)).)))))))....(((.((((((((.((.((.......)))).)))))))).)))..(((.((((((...(((((((((..(((...((((((......))))))....)))........((((((((..((((.(((.(((((......((((((((...)))))))).((((.((((.((((.((((..(((.((......)).)))..)))).))))......)))).)))).(((((.(((.....))).)))))..))))).))).))))))))))))............))))))))).....)))))).)))((((((((((((((((((((.(((.......)))..))))))))((((((........))))))((((.........(((((((...)))))))))))....)).))))))))))...........)))))))))).))).))))))))))))).)))).)))))))).)))))))))))))).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{,...,}}....)(((((((((.((((((((((((((.((((((((.((((.((((((((((((((((..(((((((((((((((((,{{.....................,.,.....,{{{..,||||{{.,.{,,,,{{{|..|||||,,..{(((((...)))))),,}}}},..},,}})),.}}|,..,)).)))))}}....(((.((((((((.((.((.......)))).)))))))).)))..,,{.{{{{((,,,{(({{(((({..{({..((((((......)))))).....||........((((((((..((((.(((.(((((......((((((((...}))))))),((((,({(,..((.(((({..,|}}||.}},..,,{|||{{.,,}.))).},,...))},.}}},.,||||}|}}..{{{{.....)))}.))))).))).))))))))))))...,,.......})}))))},,,,..)))))},))}|{((((((((((((((((((.(((.......)))..))))))))((((((........)))))){({{,,.....,{(((((((...))))))))}}}....)))}))))))))}.,,,,....,,)))))))))).))),})))))))))))).)))).)))))))).)))))))))))))).)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.