Basic Information
Symbol
hsa_MACF1_0063300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0452
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:39913364-39929358
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39447692-39463686
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-616.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-651.69 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
564.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((...........((((((.(((..............((((((((.....((((((........))))))..((((..(((.(((((.((...(((((.((..((((.((((....((((((((((.((((((.....((((((.((..(((..........(((.((((.....))))))))))..)))))))).....)))))))).(((((((((...(((((((.((((................((((..(((((((.......)))...)))).)))))))).))).........)))).)))))))))...((((((((....))))))))(((((((.((((((..((((((((....(((((((..((.((((((((((((..((((((((((((((((((..((((.(((((....))))).))))....)).)))).)))))((((((((....))))))))(((..((((((......)))).))..)))(.(((....))).))))))))...)))))........))))))).))..)))))))....))))))))((.((......)).))(((((.....)))))((((.((((((.......))))))))))...(((((((.(((......(.((((((((......)))))))).)...(((((.((.....))))))).((.(.((((.((..((((((.((.....((.(((((.((....))))))).))....))))))))..))..)))).).)).((((((....(((((..((((.((((((((.........(((.((....)).)))........)))))).)).))))..)))))..((((((.((((...((((((.(((((((((((.((((....)))).)).)))))))))))))))(((......))).....((((..(((.((((.((...((....))...)))))))))..))))......)))).)))))).....)))))).))).)))))))............)))))).)))))))..))))))))....)))).))))..)).))))).)).)))))..)))..((((.(((((.((((((((.(((((..((.((....)).))..........))))))))))).......(((....))))).))))).))))......))))...))))))))(((((..(((.....((((((.(((((((.........))))))).)))...)))....)))..)))))...))).))))))((((((.((((((((((.(.(((((((....((........))...))))))).)........................(((....)))......))))))))))((((....(((..(((((.(((.....................))))))))..)))......))))...))))))))).))))))((..(.((((..((((((((((((((((((((((.......)))))))))...)).)))).))))....)))..)))).)(((.((((.((((((((((((((((.....((((((((((..((((........))))..)))))..((((((((((.(((((((............))))).....)).))))))))))(((((((..((..(((((........).)))).))..))))))).)))))))))))).)))....)))((((((((......(((.(.((((((((((((..(((((((((....((((((((((((((((..((((......)))))))))))).))))))))((.....))....((((((.........))))))........))))))))).)))))).)).).))).))))..((((....))))....)))....)))))))).)))).)))............))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.....,,,,,|((((((,((({{{(....,..,,.((((((((.....((((((........))))))..((((..(((.(((((.((...(((((.((..((((.((((....((((((((((((((((({,.{(((((((.,{..((,...},..,.}|||}|||,.....,,,||||.{...,},)))),.....||{{|,...,{{|||||,...{{{,{{(,((((({....{{.{{{{{(((({{..(((((((.......)))...)))).}}}},|{{{{|........,,||||{|,,},,|||...((((((({....}))))))).(((((...{,((((.((((((,.,(({(((((((..((.((((((((((((..((((((((,,,(((((((..,{{{.(((({....})))).,}}|{{..||{,,,|{||,||((({{{{{....})))))})}}}...|||,,}}},..,||||.,..}))|,,||}}}},,,,,)))))))...))))}.......,)))))))}),..)))))))..})))))))))))))...))))).}}}|||||}},.{||||,((((.{(((((.,...,.))}))|||||,,,{|}}||,.,,..,,..)))||((((((......))))))},{{...((((,,((.....)))))))..}}(.((((.((..((((((.((.....((.(((((.((....))))))).))....))))))))..))..)))).).},.}))}),.,..|||||}.,.||}}}}|||,}}.......}}||}}{,,,.||{|||{{{....,}}}}||{{{{||||,,||}},{,,(((((.,{{|,,,|||{||{{||{(((((((.((((....)))).))))))))))))))))))|,{......,,)}}},,||||..|||}|||}}||...((....))..,||,},,,))..}},}......,}}|{||,,,,....}))).((((((((({.(((,,....}.))))))))).))))...,..))))))))....)))).))))..)).))))).)).)))))..))}..((((.(((((.((((((((.(((((..((.((....}}.))|||||,....})))})))))).......(((....))))).))))).))))....,.}))}..,)))))))}(((((,,({{,.,..{{{(((.(((((((.........))))))).)))...|}}..|,}}},.}}}|}...}}},|||}}}||||{{...,,{{|{|{,{.|||||||....{..,|,,,,||},.,))}}))},,..,,|........{,.........,{{|||.|||.,(((,.{(((.....))}}...,}}.},|||||}{((.....}}}..,,.,},.....,}||||||.,}||,.,||||||{,..}}})))))},,,,,,}{{..(,((((..((((((((((((((((((((((.......)))))))))...)).)))).))))....)))..)))).)|{{,|||{,||{|||||||{{{{{{.....{{{({{((((,,({{{,.,|..||)}}|..,,,}}..{(((((((((.(((((,(......,,....,}))),},,})).)))))))))|{((((((..((..(((({........).)))).))..)))))))}))))}}}}}}}),)))...,)))|||({{{{.||||||||.|}|||{{{((((((..(((((((((....((((((((((((((((..,((,....,.))},)))))))).)))))))){{.....)),,..((((((.........))))))........))))))))).)))))),.}.,..)),)))),,{(({....)))}....)))},,.)))))))),)))|,|}}..........,}))
Forensic Context
No forensic context available.