Basic Information
Symbol
hsa_RP11-420K8.2_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MACF1_0218
Host gene
MACF1
Type of circRNA
Intergenic-Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
1:39763400-39775341
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:39297728-39309669
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-116.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-128.40 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
113.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((.((((.....((((((((....((((((((((((((.(.....).)))))))))).))))..(((..(((....)))..))).....(((...((((((((.....(((((.....)))))(((((((.(((((.((......(((((((((.((...(((((((((((((((((...........)))))))(((.((((.....))))))).......(((((((((((............((((.(((.((((....)))).)))..)))))))))))))))........)))).))...)))).)))))))....)))).....)).))))).)))))))...)))).))))..)))..)))))))))))).))))(((((((..(((.......)))....)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{....,,,,.....,,|{{{(,{(((((((....((((((((((((((.{.....}.)))))))))))))))..{((..(((....)))..))}....,(((,{.((((((((.....(((((.....)))))(((((((((((.,{,.,..,....,}....,}.))))))))))){({(((..(((((....(((({{(.((.((((((({((({,.{{{{(,(,.,,,..,,{{{{{{{||.....}},,,,||,,.,{(,(((({{{{,|||{|,}..}}},}|}}}}}}|||{|....,}},}.,,)))))))}})}),)))}})))).)}.))))))....))))),))),,})))).))))..}))..))))))))))))...}.(((((((..{{{,,,...}))}....)))))))
Forensic Context
No forensic context available.