Basic Information
Symbol
hsa_chr3_0288700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MBNL1_0071
Host gene
MBNL1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:152017308-152017756
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:152299519-152299967
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-105.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-116.09 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
121.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((.(((((((..((((((...((((.((...............((((((.((....))))))))((((((..........((((.(((....))).)))).......(((..((((......(((.(((((...((((.((((((((.(((((((.(.....(((((.(((.(((..((((....))))..))).))).)))))...).))))))).)))....))))).))))...))))).)))......)))).)))....)))))).....(((((((.......))))))))).))))...))))))..(((((.........)))))........))))))).)).)))))))).((((..(((....((((((((((......(((((((((....)))).)))))...)))))))))))))..)))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((,({((,((({,.,{{(({,,....,,|||||,,.....}}})}}}.))})))((,...{{.{{{{{..(({{,{{{..{{{{(({{(,(({....,}},)),((,,{{{.(((..((((......(((.(((((...((((.((((((((.(((((((.(.,...(((((.{{{.(((..((({....})))..))).,,,.))))).,.).))))))).)))....))))).))))...))))).)))......)))).))).})}.).)).{((((((({{{{.,,....,,}}}},...))))))}).{{{({{(((({.......,,))))).,......,,,}|||......,)))),.(((,..|||..,}||||,{{{{{,..,,.{((((((({....}))).))))}.)))))),,))))))..})))).}}))
Forensic Context
No forensic context available.