Basic Information

Symbol
hsa_MBNL1_0004300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MBNL1_0174
Host gene
MBNL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:152018042-152174150 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:152300253-152456361 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-239.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -254.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 216.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.....)))))))((((.((((....(((((..(((((....((((...((((.....((((.(((((((....((..((((((((.((((.(..((...))..)..)))).)))))))(((......)))....((((((((..........................))))))))...)..))...)))))))...)))).))))..((((((...((((((...((....)).....)))))))))))).......))))....)))))..)))))....)))).))))......(((((..(((((..(((((.((.......(((((((...........)))))))((((((((.(((((((((.((((......)))).)).))))(((.....)))....((((((((((...((((((((((....))))))..))))..((((....))))..........((((((((....((((.(((......((((((((((.....))))))))))...((((((.....(((....)))..))))))................(((((.....)))))......)))...)))).....))))))))......(((((((....)))))))...(((....)))...((((.((....)).))))..))))..))))))........)))))))))))...((((......((.((((((((.(..(((.((((((((((.....)).)))))))))))..).)))))))).))......)))))).))))).)))))..)))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{((({{.,,,,|||||}|((({.{(((....{{{((..((((,....{{|{.|||{{{....,((((,,.||(({,...{{|.,(((((((.((((.,.,{{...,,..}..)))).))))))){{({,,,..||}....{(((((((.,...................,..}.)))))))}.,{|{..|{{,|,,||||..|||||{|..,..((((((...((((((...((....)).....)))))))))))).,,{|||||||....}}}|}.,|}}}),,.,))}).)}))),,,..{{|||,.,,((({((((,({........}|,|||||,,}}.....,,)))))||((((((({{((((,,(({.{{((..{{{{|,,,,))})))}{{{.....}}}....((((((((((...((((((((((....))))))..)))),{(({,....,|||,(((.......,||||||.....,.|,||,......((((((((((.....))))))))))...((((((....,(((....))},,))))))................{((((.....)))))}.......,..,|||,..,}})}}}},},......(((((((....)))))))...(((....)))...((((.({....}).))))..)))),.))))))....}}.})))))))))))..|,{,,......||,|||||||{.|..|((.((((((((((.....)),})))))))))},,}.}}}}}}}},))},...,)))))))))))|,||}}},.))},}.,,.......
Forensic Context

No forensic context available.