Basic Information
Symbol
hsa_MMP10_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0024103
hsa_circMMP10_003
Host gene
MMP10
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
11:102641233-102650092
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:102770502-102779361
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-376.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-405.28 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
281.04
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((((((.(((.((..(((....)))..)).))))))))).)).)))(((....)))....(((((((..((((((((......)))).))))))))))).....(((((((((((.(...(((((..((((((.((((((.((((((((.(((((((...(((((((((((((((((((.......(((....)))...((....))....(((((..(((.(((...(((..........(((((((...((.(((.((((......(((((((.....(((((((((((((....((((...((((.((....))))))..))))..))).))))((((.(((((((.((....................)))))))))....))))...(((.((((((......)))))).))).....((((......)))).................))))))....)))))))......))))(((((...(((((((.....(((.((.((((........)))).))((((((((((.....))).)).)))))(((((((((((((.......))))))))))))))))..)))))))...))))).)))..))....))))))))))..))).)))...))))).....((((.......))))(((((.............)))))((....))....((((((((...)))))))))))))))))))))))))))...))))).......((....)).(((((((((((((((.(((((((..((((........(((((..(.((.(((((((((((....(((.(((((((........))))))).....((((......(((..((((.....))))..)))))))..(((((...)))))))))))..)))))))))).).))))).))))..))))))).))..((((((........))))))(((((...((((((.....))))))..))).))......((((..((((..((((((.(..(((((.(((.((((....))))...).)))))))..).)).)))).....))))..))))...)))))))))))))........(((((((((......)))).)))))..(((((...)))))........)).)))))))).)))))).))))))(((..(.(((((....))))).)..)))((((((((.........))))))))...((((((..((((((((((.................))).)))))))...((((.(((.(((.(..(((....)))..).))))))))))...)))))).))))).).))))).)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{{((((((.(((.((..(((....)))..)).))))))))).,,.,||{((,...})),.,.((((((({,({{{((({......)))).)))}))))))).....((((({(((((.(...,,..,,,((((({.((((((.((((((((.(((((((...(((((((((((((((((((...,,..(((....)))..,,,...{(,.,{{((((({{(((.((.{({(((....,{{{{{({{(({....((.{,,,(((({{{...(((((((.....(((((((((({{(....{(((...((((.{.....}})})}..}))}..))),,}}),{{{,{((((((,((................,...}}))))))).,,,,))},,.(((.((((((......)))))).))).....(({{......|)}}........,,.......))))))....)))))))......,,|.(((((...(((((((....,((({{{.(((({......,)))).)|((((((((((.....))).)).)))))|(((((((((((({{....})))))))))))))))),.)))))))...))))).,,|,....,,,,|}}},,,)),,}})})))}}},}}))....,||||}}},...))))}|||,}}},,,}})}}..}}}))))..,.,|,,{{(({{{,,,...})))))),)))))))))))))))))))...))))).......((,...}}.(((((((((((((((.(((((((..((((........(((((.,{.{{.((((((((((({...,{(.(((((((........))))))).,.,,{{,,....{((((..((((.....))))..)))))},..(((((...)))))),}})}..))))))))}),}.))))).))))..))))))).)),.((((((,,...,,,)))))){{{{,...((((((.....))))))..}}}.},...,,.((((..((((..((((((.(..(((((.((,.{,({....,}))...,.)))))))..).)).)))}...,.))))..))))...}))))))))))))......,||,(({({{{......,})),,)))),.(((({...}))))........)).)))))))).)))))).}))))}{((..(.(((((....))))).)..))}{(((((((.........)))))))}..,{({{....((((((((((..............,..))).))))))),,,|(((.(((.(((.{..(((....)))..}.)))))))))|,,,{,..,.,))))}.}.))))).)))))).
Forensic Context
No forensic context available.