Basic Information
Symbol
hsa_MMP10_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0024105
hsa_circMMP10_001
Host gene
MMP10
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:102643578-102650476
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:102772847-102779745
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-323.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-344.34 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
311.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((.......((((.(((.....))).))))......))))).........(((((.((((..(((((....((((((((((((......)))))))))))).....))))))))).((....((((..((...))..))))..))(((.(((.(((...((((((..((((....))))....))))))...)))))).))).....(((((((((((((((((.......))).....((((((.(((.((..(((....)))..)).)))))))))((((.(((.((.(((.(((..(((.((((..(((....)))..)))).)))(((((((((((..((((((((..............))))))))))))))........)))))(((((...(((((((((((((((((((.......(((....)))...((....))....(((((..(((.(((...(((..........(((((((...((.(((.((((......(((((((.....(((((((((((((....((((...((((.((....))))))..))))..))).))))((((.(((((((.((....................)))))))))....))))...(((.((((((......)))))).))).....((((......)))).................))))))....)))))))......))))(((((...(((((((.....(((.((.((((........)))).))((((((((((.....))).)).)))))(((((((((((((.......))))))))))))))))..)))))))...))))).)))..))....))))))))))..))).)))...))))).....((((.......))))(((((.............)))))((....))....((((((((...)))))))))))))))))))))))))))...))))).....)))))).)))))..)))).........)))))))))))))).((....))....(((.(.(.(((((((((....))))(((((((........))))))))))))).)))).)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,,.,(({{,...,,..((((.(((.....))).))))..||.,|||,,......,||{{{{..{{{{.||({{{....((((((((((((......)))))))))))).....}}}}}|}}}.,|....{{{{..{{...})..)))).,}|(((.({{{(((...((((((..((((....))))....))))))...)))))).))).....(((((((((((((({{(,.{,...,|}..}||({{{{,.,{,.((||(({....}||{,||,|}|||||||{{{{.{{{|({.,,|}||{.,{{{{({({.,({((((,.....,)))}.})|||||||||{{,.{{((((((..,.........,.))))))))})}|||.....,,.}}}}}{((((...(((((((((((((((((((...,,..(((....)))..,.,...{|,.,{{(((((,{(((.((.{{{(((....,{{{{{({{(({....((.{,{{(((({{{...(((((((.....(((((((({({{(,...{(((...((((.{.....}})})}..}))}..))),,}}),{{{,{((((((,((................,...}}))))))).,,,,))},,.(((.((((((......)))))).))).....(({{......||}}........,,.......))))))....)))))))......,,},(((((...(((((((....,((({{{.(((({......,)))).)|((((((((((.....))).)).)))))|(((((((((((({{....})))))))))))))))),.)))))))...))))).,||,..,.,,,,|}}},,}}},,}})})))}}}}}})}....,||||}}},...))))||||,},},.,}}}}}..}}}))}|..,.,|,{{{(({{,,,,...})))))),)))))))))))))))))))...))))).....)}))},.}))}}..)))},,,......)))))))))))))).{{....))....}||.{.{,({(((((((,...}}|}(((((((........)))))))))}))}},,,,.},)))..,
Forensic Context
No forensic context available.