Basic Information
Symbol
hsa_MMP9_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0060571
hsa_circMMP9_002
Host gene
MMP9
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:44641894-44645200
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:46013255-46016561
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-402.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-420.85 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
274.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((.(((((.((((((..((((.....((((((((((...(((((((((((((((...((((((......)))))).............(((((((((((((......(((......))).((((.((((((((((.(((((((((....((((((..(((...((...(((.((....)))))...))))))))))).....)))))..........(((((((.((....)))))))))))))..)))))))..........)))..))))......))))...)))))))))..))))))))))...((.(((((.(((.............))).)))))))(((((.((.(((((((....))))..))).)).))))).....((((((.....))))))...)))))....))))))).(((.(.(((((((.((((.((...)))))).)))))))))))...))).....))))....)))))).)))))...))))))((((((((...((((((((((.((.(((..(((((.(..(((((((.(((((.((.((.(((((....))).....)).)).)))))))))))).))..).)))))))))).))))))..(((((...((((.(((.....)))..))))))))).......((((((((((((((.((...((((((.((((.((....))..)))))).))))....)).))))))...))))))))............((((...(((.((((..((((.(.(((((....)))))))))))))).))).))))...((((((..(((.....)))))))))....(((((((((.......)))))))))...)))))))))))).(((((..(((.(((((.((((...))))))))).))).))))).......(((((((....(((((.....)))))..))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,,..((((((.(((((.(((((((({(((,..{,((,(((((((,,.(((((((((((((((,,,((((((......)))))).......}}}...(((((((((((((..,,,{((({.{,,.||}|{{((,{(((((((((.(((((((({....{{{{{(.,(((,..{,...||||{{....)))))...))),}))))))..,..)))))..........(((((((.((....)))))))))))))..)))))))..........}})..))),,,,...))))...)))))))))..))))))))))...(.{(((((.((((((({..{((({...,{|||,,(|(,,,,..|}},,))}|...})))},..))))))).)))}}}..{(((((.....))))))...))))),,..))))))),{|{.,.(((((((.((((.((...)))))).))))))),,},.,,))),..}})),))),.,))))).)))))...))))))((((((((,.,((((((((((,(({((({{(((((.{..(((((({{(((((.((,((,,(((,....,,|...|||}|)),),)))))))))).))..},})}}}|||,,.,})}))}|,|||}}}}}|||}|{|},.}.})}}}))).,..,,.......((((((((((((((.((.,{((((((.((((.((....))..)))))).)))).}..)).))))))...)))))))).||||.,,...,||||,,,(((.((((..((({.,{{(({{....)))))}))},)))).))).},,,...((((((..(((.....))))))))),{{{(((((((((.......))))))))).,}))}))))))))){(((((,,(((.(((((.((((...))))))))),))).))))).....,,(((((((....|||||,,,..}})))..}})}}}}....,
Forensic Context
No forensic context available.