ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_MMP9_0000500
Basic Information
Symbol
hsa_MMP9_0000500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0001162
hsa_circMMP9_003
Host gene
MMP9
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:44643023-44645125
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:46014384-46016486
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-118.50
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-125.03
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
41.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((...(((.(((...((((..((((.....))))..))))....))))))..))))(((....(((...(..(.((((((((.((........((((((((((((((.((...((((((.((((.((....))..)))))).))))....)).))))))...))))))))............((((...(((.((((..((((.(.(((((....)))))))))))))).))).))))...((((((..(((.....)))))))))(((((((((((((.......))))))))).)))))).))))))))...)..)..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((...(((.(((...((((..((((.....))))..))))..}.))))))..))))(((....(((.{.(..{.((((((((.{{.{{.,,..((((((((((((((.((.,,((((((.((((.((....))..)))))).)))).}..)).))))))...)))))))).,{{,....,,,{{{(...(((.((((..((((.,,(((((....))))))))),)))).))).))))...((((((..(((.....))))))))),||,(((((((((.......))))))))).}))}}).))))))))...}..},.))))))
Forensic Context
No forensic context available.