Basic Information

Symbol
hsa_MMP9_0000500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0001162 hsa_circMMP9_003
Host gene
MMP9
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:44643023-44645125 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:46014384-46016486 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-118.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -125.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 41.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.