Basic Information

Symbol
hsa_MTO1_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MTO1_0034
Host gene
MTO1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
6:74181183-74190528 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:73471460-73480805 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-833.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -881.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 598.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((....))))..)).))))(.((((((((...((.(((((((.((((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((..((((((((((((((((((.(.((((((.(((..(((((((....((((((((((((.((((.(.((((((.((((.(((((((((((.(((.((.(((..(((((((.((((((.(.(((((((((((((((....((((((.(.((((((((((.(((((((((((...((((((.....))))))...))).((((((........(((((((((....((((...........(((((((((...........))))))))).((((.(((((((..........(((((((((((((((((....)))))..)))....))))))))).....(((......)))....((((....))))..........)))))))...)))).........................((((.((((((.......(((((((....)))))))....(((((((.........((((((.((((...((((......................))))..)))).))))))..)))))))...))))))))))....(((((((....(((((...)))))))))))).(((.......)))((((((((((.....((((((.(((.((((((((((((((((...((((.((.(((((((...........................((((((.......))))))...)))))))...(((.(((...........))).)))....((((.....(((((((...(((((((.(((((..(((...)))..))))))))).))).....))))))).....)))).......(((((((((.....(((((((((((...))))))))))).(((((....)))))........)))))))))(((((((....((((((.(((((.((((..((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((.....(((..((((.(((((((...(((((......))))).....)))))))))))....))).....))))).)).)))))).................)))))))))))))...(((((......)))))(((.(((..(((.((((...)))))))..))).)))..))))).)))..))))))))).))))))......))))))).....)))))).)))))))))).......)))))).))).)))))).....))))))))))...((((...((((...))))..)))).....((((((((((............))).))))))).....((((((..((((((......(((......)))......)))))).)))))).((((.....)))).))))...)))))))))))))))...((((((......((....))......))))))......)))))))).)))))))))).).))))))........))))))))))))))).).)))))).)))))))..))).)))))..)))))))))))))))..)))))))))))..)))))))))))).)))))))..))).)))))).).))))))))))))))))))..)))))))))).))))))))))))))))))).)))))))).....((.(((.((((((((..((((((.((.(((((((((.(((.(((((.((((((((((((((((((((((.(((..................(.(((...((((((((..((((((((.(((......(((((.....)))))......))))).))))))((((((((...........((((((((....((((((........((((((.......((((..(..((((...(((((((....)).)))))(((.(((..((((((((..((..((((..(((((...((((..((((.......((((((((.(((..((..(((((((((....((((((.................)))))).....)))))((((.((.....)).))))...(((...)))((((((((..((((..........))))...))))))))...(.(((........))).).....))))..))..))).))))))))))))..))))...)))))..)))).)))).))))))..))).)))..........))))..)..)))).....))))))......))))))....))))))))........))))))))...((((..((((((((((.........)).))))))))..))))((((....))))))))))))...))).).((((((((((..((....(((....)))...))...(((((.....)))))...)))))))))).))).)))))))))))).))))).))))).))))).))).))))))))).)).))))))..)))))))).))).)).))))).)))).))((((....))))..((((.......)))).....(((((((..(((.((..(((((((..((.((((((.....))).)))))..))).)))).))))).)))))))))))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((....))))..)).))))(.(((((((((((((((({{(((...((((((((.(((((((((((((((((((.((((((((((..((((((((((((((((((.{.{(((((.(((.,(((,((({{..((((((((((((.((((.({((((((.((((.(((((((((((.(((.((.(((..(((((((.((((((.(.(((((((((((((((..,.((((((.(.((((((((((.((((((((,{,...((((({.....))))))...||,,((((,,{{(({...,,,,,,|||}}..||||}|.........{((((((((...........))))))))},{{{{.{{{{{{,..........((((((((((((((({(....}))))}})))....))))))))).....{((......))}....((({....}))}..........,,}}}}}..,|||}...........,,,|,.........(((,{((((({,,,,..,,,{{{{{,..})))||||,,..{((((((.........,{{(((.((((,..((({................}....,)))).,))}}.}}}})}..))))))),,,))))))))))....{{{{{{{.,,,(((({...}))))}}}}}}).{{{.......}}}((((((((((.....((((({.(((.((((((((((((((((...((((.{{,((,{{(({{({{,.,{,,,,..............{(((((.......)))))}..,|||||||.,.(((.(((...........))).)))....,(((.....|||,,,,...{((((((,(((((..{,,...}}},,||||}})))|))},,,,|})))}||{{{..||||.,{,,,,(((((((((.....(((((((((({...})))))))))},(((({....})))).,,.....))))))))),{,{{||},,,||||{|,|||{|,||{{.|(((({|(({((({{,{|||{|{.,{{{{.{{{{{,{...,,||{..||{{.({({{|{,,..,,{|,,}..,))))})))))))))))))))),{{{|||{{...||||,,|,.,(((((((...)))))))...}},,))))}}})),,}}}|||||}}}}}})))}){{{.,....,,,.{{{{{{.||||{{{..{{{{|||..,,}))})))}.,)))))))}.)))}}|{{{...,,)))),.}}}.}})))).)))))))))}......,)))))).))).)))))).....))))))))))..,(({{|,.,{{,...}}}}||}}|,.....((((((((((..........,.)))},)))))}.}},.((((((..((((((......{{{......}}}......)))))).)))))).{{{{,,...)))),}}}),,,})}}}}}}}}}}}}}...{{{{{|,....,||}...}}......}}}}})......)))))))).)))))))))).).))))))........))))))))))))))).).)))))).)))))))..))).)))))..)))))))))))))))..)))))))))))..)))))))))))).)))))})}}))}.)))))}.).))))))))))))))))))..)))))))))).))))))))))))))))))).))))))))...|}||}(((.((((((((..((((((.((.(((((((((.(((.(((((.((((((((((((((((((((((.(((..................{.(((...((((((((..((((((((.(((.....{(((((.....)))})}}....))))),})))))((((((((...........((((((((....((((((........((((((.......((((,.{..((((...{((((((....},.))))}(((.(((..((((((((..{(..((((..(((((...((((..((((.......((((((((.((({((((.((((((((,.,,,((((((...........,.....)))))).....,}}))||,|,|,.....,|.,.,,...(((...)))((((((((..((((..........))))...))))))))...{,,{{.......,))},...,,,})))..)))}))).))))))))))))..))))...)))))..)))).}})).))))))..))).))),.........))))..},.)))).....))))))......))))))....))))))))........))))))))...((((..((((((((((.........)).))))))))..))))((((....))))))))))))...))).,.((((((((((...,....,((,{,.,,,,.,))...(((((.....)))))...)))))))))).})}.))))))))))))},))))))}))).))))).))).))))))))).)).))))))..)))))))).))),||{}}..,,{{{(,((((((.,..}}}}..||,|.,,}}..||||...{{..,...||{{{.{{...,{,,,||..}}.}}}}}..,},,))),}}}}}..)))},}},.))))}.,)))}..})))))))...)
Forensic Context

No forensic context available.