Basic Information

Symbol
hsa_AF001548.5_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MYH11_0361
Host gene
MYH11
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
16:15820555-15841652 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:15726698-15747795 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-609.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -641.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 401.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((...((((....((((((((..((((.....((((((((.((......((((.(((.((((((((.(((((..(((..(((((.(((....(((((.(((((.(((((.((((((.(((.((((((((((.(((.......(((((..((((((((.((((((.(((...(((((.((((.(((((...........((((((.......))))))....((....))(((...(((.........................))).)))..))))).))...)).)))))...))).))))))((((((.......((((((...(((((........))))).)))..))).......)))).)).))))))))...))))).........)))..))).))))......(((((((...)))..))))......(((((...)))))......(((((((......((((...........)))).......)))))))(((....)))).))))).))))))....))).))..))))).)))))....))))))))...)))))))).)))))))).))))))).....)))))..)))))((((((((((((((((...((((((..(((((((((........)).))))))).....))))))..))))))))(((((((....)))))))......((((....))))..))))))))(((((((...((........))..)))))))......((...))....))))))))))))...))))))).)((((((((((((((((.........))))).........((((.....))))......(((((((((.((((((((((....(((..((.(((((((...(((.(((.((.((((.(((....)))..)))).)).))))))..(((((((((..........((((((....)))))).......(((.(((..(((((....((....(((((.((.((((((...((.(((((.(((.((((((((.................)))))))).....((((...((((((((((((((.((....))(((((((..........(((((((((.((.....((((((((....))))))))...............((.(((.((((.((((((((((((............)))))))............((((...((.....))...)))).....))))).)))).)))...))........((((((((((.(((((((...........).))))))...))))).))))).........)).)))))).)))............((((.....))))........(((..((((((((((..(..((.....(((((.(((.......))).)))))......))....)..)))......))))))).))).......(((((.........))))))))))))....))))))))))).))))))).(((.....))).....(((((..(((((((.((((((...(((....(((....))).....)))..))))))...)))....))))..))))).)))))))))).)))))).)))))))...))...)))))..))).)))...((((....)))))))))))))....(((..((((((..((.....)).))))))..)))..)))))))..))..)))..)))))))))).)))))))))...))))))(((((.(((....))))))))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((...{(((.,..((((((((..((((....,((((((((.({,{....((((.(((.((((((((.(((((..(({..(((((.(((....(((((.(((((((({{{.((((((.((({((,(((((((.(((.......(((((..(((((((({((((,,.,,,...|||,|}|||..(((,..{{........((((((.......})))))...,||..,,}}||....|}}.............,...........{{..(((((((((..(((......,.)))..))))))))).||((((.......((((((...(((((........))))).})).,})).......)))).,}.})))))))...))))).........)))..))).))))....{.{(((,,{...}))..)))),,....(((((...)))))......(((((((......((((..,........)))).......)))))))(((....))),.))))).))))))....)))))}...)))).)))))....))))))))...)),))))).)))))))).)))))))....}))))),.,))))((((((((((((((((..,((((({..(((((((((,,.....,)),}}))))).....))))))..))))))))(((((((....)))))))......((((....))))..))))))))(((((((...((........))..)))))))......,{.,,},,...))))))))))))..,))))))).)(((((((((({(((((.........)))))...,,....((((.....))))...,.|(((((((((.((((((({{{.{{{(,{{{(((((..((((((.,{.((.......|}}},.}))))),}))).)}).....}}}|....,,,,.,......|,||||,{(({{{..|||,,{{.,,....(({{....))))..,,.},.|||,||}|||.,,,..||,,,({(((....,{{({(((((,..,,,,,...,,....})))),}||{..,{||,||||,......,,}||||,||,...}}|,{((((((............)))))}.......((((((((....))))))))((((((((((...((((.....))))(((((((.((((.((.....({(((((((((((..,,,......((((...{,.....}}...))))....||||||||((..((((.((((.{{,,..((((((((((.(((((({.({........),))))))...))))).))))).........))..}).)))).))))..}}}....((((.....)))}........||{,,,.||||{,(({.{{((((,...(((((.(((.......))).)))))......{{{{..((.(((..,,,,|||{||({((((((((....)))),.})}}...,}.,)))),}),..})),))..)))),||{{((((((({....{(({{{{.((.....)).))))))}))),))}))),...(((....))).....))))))).)))...,......)))))))}}))....)).))))..(((((..........))))}{{{.....})).))))))){{{....))},))))))))))...(((..((((((..((.....)).))))))..)))..))))))..,)).})))}})))))))))).))))))))}...)))}}}(((((.(((....))))))))....)))))
Forensic Context

No forensic context available.