Basic Information

Symbol
hsa_NDE1_0009200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-MYH11_0162
Host gene
MYH11
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
16:15813460-15818173 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:15719603-15724316 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-275.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -288.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 202.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((......((.((((((..................((((((((((((((........(((((((...(((.((((....((((....((((.....))))...))))..((((((.....)))))).....(((((...((.((.....)).))..)))))((((((......))))))....)))))))))))))).....))))))))))))))))))))))....(((...((((((....(((((((....((((....))))((((((....)))))).........(((((.......(((((...)))))..)))))........)))))))....))))))...))).)).)))(((.(.(((((((..((((.((.....((((((((((((((..(((((((.....((..(((...........((((..(((((((...)))))))..))))......((((((...(((((........))))).......))))))....((....)).....((.(((((.((..(((((((.(((...(((........((((((....(((((......))))).))))))((((((((((...(((..((........)).....)))...))))))))))((((.((((......)))).)))).......)))..)))))))))).)).)))))...))..)))..))......))))))).)))))))))..((((((((........))))))))......((((....)))))))))......(((......)))(((((...))))))).))))..........))))).)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((,.....(({((((((..................((((((((((((((........{((((((...((({(((,....((((....((((.....))))...))))..((((((.....))))))..,,,|{||,,,,,|,||.....)).))..}}}}}((((((,,,...}})))).,,,)))))},))))))).....)))))))))))))))))))))){{{.{((...((((((....(((((((....((((....))))((((((....)))))).........(((((.......(((((...)))))..)))))........)))))))....))))))...)))})).)))(({{(.(((((((.,(({(.{{..{{{(({{,(((((((((..{((((((.,.,.||,||{{...........{{{{..{((((((...))))))|,.}|||....,|||||....}||{({....,,,.)))}}...{{{{(((((((...((....))...}})))|||||}{{..{{{((((,{,({,,({(..,,,...,(((({,...||{{{......))))),))))}|((((((((((...(((..((........)).....)))...))))))))))|{{{.{{{|......)))),)}||......,}},..|))}}))))}.}},.,,,........,|,........,}))))))).))))))))).,((((((((........)))))))),.....((((....))))}}))),,...,{||......))){{{,,...,)))))).)))|....,,..,.))))).)).})))
Forensic Context

No forensic context available.