Basic Information

Symbol
hsa_NBEA_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0100316 hsa_circNBEA_007 hsa-NBEA_0006
Host gene
NBEA
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
13:35615070-35685115 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
13:35040933-35110978 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-456.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -488.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 546.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((.(((.......(((.((.((.....(((((((((((..((((.(.((((((.((((((.((((((((.((((((((.((((.(.(((((((((((..((((...((...((((((((((((.((((..((((......))))............(((((....(.(((..(.....)..))).)..))))).....))))))))))...))))))....))....))))..))))))))))).)((((((.((.((((..((((((..(((..(((((.(((.((..(((((((((.(((..(.(((.((((((((.((((((..((((..((.((((....))))..))..))))..)))))).))))...(((...))).(((........))).))))))).)..)))..)))).)))))..)).))).)))))...))).(((((((((....(((.(.(((..((((.......((((((((.((((((..((((((((....(((((..(((((((.....)))))))..)))))........(((((((((((((.((....)).)))).)))))))))....)))))))).))).)))...))))).)))))))..))).).)))(((((((((((.....(((((....(((((....)))))....))))).((((((((.((((.......))))..)).))))))......(.(((((((((((((..(((.(.(((((.......))))).).)))...))))))))....))))).).......((((((((.((((((((((((......))))))((.(((.((((((..((.....))..)))))).))).)).)))))).)))))))).......(((....((((((((((((((((..(((.(((((..(((..((((...............((((.((((((...))))))..)))))).)))))..))))).)))..)))))))....)))))))))....))).....)))))))))))))))))))))))))).))))..))..))))))............((((((((........))))))))..))))))))))))((((((((((((((...((....))..))))))..................((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).)))))))))))....((((((((...((((((...((....)).))))))...((...((((((.((((..(((..((((((.......)))))).)))..))))...)))))).))(((((((..((((((....)))).))..)))))))(((((.......)))))((((.....)))).))))))))))))))))........((((.(((((....(((.((((......)))).)))....))))).)))).)))))))).)).)))).))))...)))))))..)))))))).))))).)).)))(((((((((.......................)))))))))..(((........)))))).)))))((.(((.....)))))..........)))(((((.(.........(((.((((((((((((..........)))..))))))))).))).........).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,{(((({{({......,{(({((.,{..||||,.((((((((,,((((.(,{{{{{{.((((((.(((({(((.,{{{{(({,|(((.|,(((((((((((,,{{(({{,((..,({(((((({((((((((,.({{,...,{{||||,.......,,.{((((,....,}|||,.|,,.,,},,}}}.,.,}}}}}....,}}}||||||||..|}|}}}.,.,||,{..}))).,)))}))))))}||((({{{.||,{{||,,|||||(,.{{{,,(((((.{((.((..(((((((((.(((..(.(((.((({((((.{(((((..((((..((.,(((....,})),,))..))))..)))))}.)))).{.(((...)))}|((........)),.})))))).)..)))..)))).)))))..)).))}.)))))...)}}.{{{{((({{....|||,|}||{,,{{,{.,,,..{{{{{{{{{,{{{{{{{{((((((((,,,,{{{{{..(((((((.....)))))))..))))}........(((((((((((((.({....,).)))).)))))))))..|{|||,,,))})}|,|||..{|||||.||,,.,,..,,)),,)))||{{{{|||{{|,,..{((((....(((((....)))))....))))}.((((((((.((((.......))))..)),,)))))....,|||||||||,||}}}}))}},,}}|((((...,|,||||||,}}}}},)}))))}.},,,.,,|}}}|||..,...((((((((.((((((((((((......)))))}((.(((.((((((..((.....))..)))))).))).)),)))))).))))))))......,||{..,.{{{{{(({{{{({(((..{{{.(((((..{|{.,||||..}}}},,|,.....{({{.{{((((,.,||}}}},,||||.|,|||||..})))).))}..)))))}}....})))))))|,|,,|||,{|..|||,}})))}})))))}}}})))))).}))),,)),.}))))},}},},....|.((((((({,{.....,)))))))).,))))))))))}|((((((((((((((...((....}}..}})}}},...,,,.,,{{{.,,,.((((((((((.(.((...(((((.......))))).)).))))))))))),,,..|||{||{...((((({...{(,...,),))))))}||{(|,,((((((,((({..{(({{((((((.......)))))).}})}})}}}...,}||||,||(((((((..({((((....}})).}}..))}}}}}(((((.......})))){(({{.....,}}.)))))})))))}}|||,.......{{{|.({{{{....({(.(((|......}))}.)))....})))).)))).)))))))).)}.)))}.})})...})})))},)))))}})}.....|,||.|,.|||((((((.......,,......,...,...))))))}},..{|{........})}}},.}}))}||.,{{.,,,,}}}}}....,,,,,.}}}(((({.|.........,,,.{(((((((({{{.......,,.}}}..))))))))).}}}.........).)))))
Forensic Context

No forensic context available.