Basic Information

Symbol
hsa_NCOA5_0000700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NCOA5_0027
Host gene
NCOA5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
20:44693668-44699175 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
20:46065029-46070536 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-241.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -258.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((...((((((((...........))))))))...)).)))))(((.(((...(..((((..((.......))..))))..).))).)))(((((...)))))..............(((.......)))..((((((((....(((((((.((...((((((((((.(((((((..(((((....((((((..(((((...)))))..((((((((.(((.((((((((.(((.(((...))).(((..(((((.......))))).))).(((((....).)))).))))))))))).)))..)))))))).))))))......((((((((((((.(((.(.((((((...(((((.((.(((((.((((.....(((((....(((((.(((((.(((((....)))))...)))))((((.....)))))))))))))).)))).)))))...)))))))....))).)))).)))))))....)))))))).((.((((....)))).))....(((((...)))))..(((....)))..(((..((((.((((..((((.....))))))))))))..)))..)))))..)))))))(((((.((((.....))))((((.(((((((((((((.................)))).)))))))))...))))(((..((((.(((((((((((...)))).)))))))....))))..)))...............))))))))))).))))...)).)))))))....))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(({({..{(((((({{,,{,,,.,...||||||||,.{||,||}}}{{,.,{{,.|{,,(((({.{,.....{{||{{|,,|.{|,,,,.|}|(((((...)))}|.............,||{.....{|||}..{{{{||||.{{{(((((,({((,.,(,(((,((,(((((((((,,(((((,,..{{{|{.{{{{{{{|..}||||,.((((((((.(((.((((((((.(((.{{,...,}}.(((..(((((.......))))),))}.(((((....).)))).))))))))))).)))..)))))))),})),}..,....((((((((((((.(((.{.((((((..,(((((.((.(((((.((((.....(((((.,..,,,{{.(((((.(((((....))))).,,)}))|((((.....)))))}}},))))).)))).))))).,,,})))))....))),})),.)))))))....)))))))).((.((((....)))).))....(((((...)))))..(((....))),}||}}.|||}}|||}}}}|,|}{{{......,,))),,..}})}.))))).})))))))}||,|.,{,|}}.}..)))||||.|,,,.,|||||}||,|||||,,.......,}})}})))}}))),),.)))}|||,.((((,{{((((((({(,,,||}},,|||||,.,|.},,),.}}))},,.,..}}}...})),)))))))}.}})).,,,,,})))}))},..))},,,,)
Forensic Context

No forensic context available.