Basic Information
Symbol
hsa_chr16_0275500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFATC3_0110
Host gene
NFATC3
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
16:68160036-68160871
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:68126133-68126968
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-226.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-244.32 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
186.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((.((((...(((((...........))))))))).))))))(((((.((((((((.......))))))..)).))))).......(((((((.(.((.(.(((......))).).)).)...)))))))..((((((.(((..((((..(((((((...........(((((.((((((...((((...((((((...((((...)))).)))))).))))..(((.((((((....(((.((((((..(((.((((....)))).)))....))))))..)))....))))))...)))..........((((((((((((....((......))(((((((....)))))))......((((....((((((.(((..(((((....(((((((...((((.......))))..))))..)))....)))))..)))))))))....))))......)))))))).)))).)))))))))))...........((((((((((((....))))).((((((((...)))))))).....((((......)))).....................)))))))......((((((((.((((........)))).))))..)))).....))))))).....))))...............((((((((.((((((((....))))))))...)))))))).....))).)))))).......(((((.....)))))....))))).))))))))))))))))).)))))))))))))(((.((....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((.((((...(((({.,,,....,}}))}}})))).))))))(((((.{,((((((.......))))))..},.)))))...{,..(((((((.,.((.{.({{......))).).}).}...))))))),,{(((({.(((...(((......,,,,,,,||....,(((((.{{{{{{....{((,..{{{{{{...{{{|,,,}}}}.))})))})}},.,|||.{{((((..,.(((.{(((((..(((.((((....)))).)))....}))))}..})}....})))}}...|||..........((((((((((((....((.....,},(((((((....)))))))......((((....{((({{((((..(((((..,,(({((((...{(((.......}}})..}}})..))),,,,)))))..)))))))))....)))),},...)))))))),,))).))))))))}}}..................(((({,,,,|||||,((((((((...)))))))}.....{(((......)))),.,||,,|||,.,......,},...,,}},....{{{,{{{{.{{{{........}}}}.)))),,),},.....))},})))}))))))..,{{,,....,}}},{(((((((.((((((({....})))))))...)))))))}.....))).)))))).......{((({.....}})}}....))))).))))))))))))))))).)))))))))))))(({{((....)))))
Forensic Context
No forensic context available.