Basic Information
Symbol
hsa_RP11-96D1.5_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFATC3_0109
Host gene
NFATC3
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
16:68249880-68251053
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:68215977-68217150
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-276.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-299.05 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
312.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..................................((((((((.(((..(((((......)))))...)))...))))))))...((((...((((((((((...(((((...........((((.((((....(((((.....))))).(((((((...)))))))....((((.((...(((..((((.....((((....(((((........))))))))).................((((((((.(.(((....))).))))))))).......((((((((.........))))))))...)))))))..))..))))..((.((.((((((((.........((((.((...(((((.((((((..((.((((((....)))))).))....)))))))))))..)).))))..............((((............)))).)))))))))).))..)))).))))..))))).....)))))))))).)))).(((((..(((((.....(((((((((((((((((((..((.....((.((((...((......))...)))).))..))...)))))....................((((......))))...(((((((..........)))))))..(((((((..(((..(.(((((((((....)))))))))...)..))).))))))).))))))).(((((..(((.((((((..((((((((((......))))))))))....)))))).)))....)))))..((((((((.((.((.................)).)).))))))))..((((.(((((..(((((.........(((((((((.(((.................................))).)))).)))))..((((((.((((((..................(((......)))(((.((((((..........((((((.............)))))).))))))..))).))))))...)).)))).............)))))..))))))))).....))))))))))))..)))))....((((.......)))).....(((((((......)))))))..........(((((....))))))))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({......,{{(({((.((({{(({{(((({,...}}))|||((({((({.{(({{,,,,,,|||||.{{{..,{,||||,,,}}}}}|.,}}},|||||,,,....,,,...|}.}},,,},|,,..{,.,....(((((.....))))).{(((((,...,}))))},,,,{,,,.,,...,{,..{{{{.,....||{....{{{{{.,......)))}},,.,,................{(((((((.(.((,....})).))))))))),}}}}}},,,,,{|,{{,,{{{{,,.||||||,..,,,}))}}||,{{||||,.{{,{{,((((((((........,,,,,.{{...((((,,((((((..((.((((((....)))))).))....))))))))))).....||||......}}}}....{{,,............})}}.}))))))))},}|,,|})}|}},....,|||||...,}}}})))))})))))}|},..,{{{{{..{((((({{{{((((,,((((.((.({,,...,,.||||}.}|}}}}}}.})})}))},.}}|,}}((({.,,}}}}}}}}})}}.}}}}}},,(((,....,,))}|,{((((((({.....,,,,.))))))}.,|{(((((,,{,{.{{|{((((((((....)))))))))}}....})}.}))))}}.........(((((..(((.((((((,.((((((((((......)))))))))).,..)))))).)))....)))))..((((((((.((.((..............,,.)).)).))))))))..((((.(((((..(((((.........{(({(((((.(((..........................,......))).))))},}}}}..((((((.((((((..................(((......)))(((.((((((..........((((((.............)))))).))))))..))).))))))...)).)))).............)))))..)))))))))..,,{||||,|{{{({{...,,......((((.......))))..,}}||||{{{,.,.,,)}}|}},.||}||,,.{((((|....,)))))))|.,,)
Forensic Context
No forensic context available.