Basic Information

Symbol
hsa_AC007787.2_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFIX_0030
Host gene
NFIX
Type of circRNA
Intergenic-Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
19:13135904-13206022 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:13025090-13095208 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-852.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -888.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 531.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((.(((.(((.(((.((((((((((.((.(((..(((((((((((((((......(((((((((..(((((((((((((((((..(((...)))))))).....))))).)))))))))))))))).((((.(((((((((...((((((((((((((......((((.((((((((..((((((((((((((..........)))))).(((...(((((((((...(((((((((..(((....))).)))))))))...)))))))))...)))))))))))))).).))))...))))....))))))))((((.....))))))))))...))))))))).)))).((....((((.(((((.....(((((((((....))).))))))((..(((((.(...((.(((((((((((((((.((((((...))))......(((((((((((((.(((..((.(((((((((((.........((((((...........))))))(((((((((((((...(.(((.((((((((..........)))))))).))).).)))))..(((.(((((((..(((....))).))))))).))).....((((((......))))))))))))))(((((.(((((...)))))))))))))))))))))((((.((..((.(((((((.(((((((((((....(((....(((...(((...(((.(.((((.(((((((((((((..((((((((((..........(((((.......)))))..)))))))))).))).)))))))))).)))).).))).)))..(((.......)))((((..((((((((((..((..((((.((((.(((((.....(((.(((((((((.((((...)))).))))))))))))..((.(((((.(((((((((.((.(.(((((........)))))..).)))))).((((...((((((((.((...((((((.(((((((((((...(((..(((..((((..((((((........)))))).(((((..((((.(((((.((((.....)))).))))).)))))))))))).)..)))..)))))))))))..))).))))))....))))))))))...)))).(((((((..((..(((...(((((((.(((((((((.((.(((((((.......)))....((((((....)))))))))))).)))))((.(((.....))).))))))((((....))))))))))).)))..)).))))))).))))).))))).))(((((....(((((((((.(((....))).)))).))))).....))))).((((((.(((((((((.........(((.(((((((...((..(((((..(((.(.(((((...))))).)((((((.((((((((.((((...((((..................)))).....))))))))))))...)))))).....))).)))))..))....))))))))))))))))))).)))))))).)))..))))))))..)).)))))))).)).))))...)))..))))))))))))))))))))).))..))))))...........))..).)).))))))))).)))))).)))))))))((((.......)))).((((((.(((((((.((....)).))))))).)...((.....))..(((((((((.(((((.....))...))).)))))))))))))))))))).))...).)))))..))..((((((.....))))))..))))).))))....)))))))))).)))).)))..))))))))))))).)).))).)))))).))))))....)(.((.(((((.......))))).....((((....))))..)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({(((((((({((((((.(((.((((((((({{((.(((..(((((((((((((({,,{{..(((((((((.{((,((((((((((((((..(((...)))}))),,,..})))))})),))),))))))))).((((.(((((((((...((((((((((((((......((((.{(((((((..((((((((((((((..........)))))),|{|,..||{||((((.|,(((((((((,,(((,...,)).})))))))).,.))))))))),..}}}})))))))))).).)))).,.))}}....))))))))((((.....))))))))))...))))))))).)))){((...}}}..{({(((({(,.{{(((((((....))),)))}}|(({{({(((.{...((.(((((((((((((((.(((({.....}}}.....,((((((((((((((({{,((((((,,,.,,,,............,.,,||||||,....(((({.,,|||||.(((((,{{(,,,(,((((((((..........))))))))})))}).)))))..(((.(((((((..((,....,)).))))))).)))((..(((((((......)))))))..))|{(((((({((,,,.{{||{{{,{{{(({(({||{(({.,((,((.,{{,((((((((((.((((,,,,....,...((((((.((((...((((.({{,,,.(((((((((((((..((((((((((.........,({(((......})),))..)))))))))).))).))))))))))})))))(((((.((((.((.(((...((((((...((((((((((..(((({((((.,....,.,},}},,}(||.,((((((((.((((...)))).)))))))))))).,,},}..)).))))))))..)))))){((....)))))))).)))))))))))))))))))(((((((,{((...((((((.(((((((((((...(((..(((..{(((..((((((........)))))).(((((..((((.(((((.((((.....)))).))))).)))))))))))).}..)))..)))))))))))..})).)))))),...))))))))))..)))))))|)))|}},|.,..,.}}}|,||..,.,})))))))}||,}}}}.}}}}))...)))...)))))))}{{.||||||{{{||,.|{{({((.((((......)))).)))|{{(,,,.}}}||,|||||,{||,,}},)}}||}|{({.{{(((||({{.(((((...,(((((((((.(((....))).)))).))))}.....))))).((((((.(((((((((.........(({{(((((((...((..(((((..{{{.,.(((((...))))).|((((((.((((((((.((((...((((...,,.,.....,.....)))).....))))))))))))...)))))),....}}}.)))))..)).,..))))))))))))))))))).))))))...,.||||||||,,,})),}).))).))))))))).)))))).})))))))))))))),,))|||||}..))))).........,},}},.}.)),))))))))).)))))).))))))))).,((({,,{{..{{{,{((((({((....,.,,.}}})),}})}|}|,}}..)).,}}.,},,(((((((((.(((((,....})...))).)))))))))}}}}.})))}),))...).})))),}})})))))}|.||||))}|||..,)))...,}}}}..)}))))))))}}))).)))..))))))))))))).)).))).)))))).))))))....}|,,|}||,{,,{{,,..,,|||{,...((((....)))).,)),)
Forensic Context

No forensic context available.