Basic Information

Symbol
hsa_NFIX_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFIX_0041
Host gene
NFIX
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
19:13120851-13122263 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:13010037-13011449 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-550.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -573.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 441.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((...(((.((..........))..)))((.........))............................((((((((((....)))))..))))).)))))))...........)))))))(...((......((...((((((..(((((((.(((((((((.(((((.((((((......))))))..(((((((((....))))))))).)).))).((((.(((.((((...(((((..((.(((((........))))).))..((((..((((((((((...)))).....((((.((....)).))))..((.(((....(((((...((((((((((((((((............))))).)).))...))))))).....)))))....))))).(((((((....(((((.(((((.(((((.((((((.......((......))........)))))).)))))......)))))..)))))................(((((.....)))))......((((((((((.................((((((((.......(((((.(((....))).(((((..(((((((..(((.......(((((((..((((((((...(((.(((((((((((.(((.........))).))))).....)))))).)))....)))..)))))...((.(((((...))))).)).(((.(((((....((((((..((((.....))))...))))))...))))))))((((((....(((.((((.((((((..........))))))...))))(((.(((...((((((((((((........)))))...)))))))...))).)))...((((((....))))))))))))))).((((....((((....))))....)))).((((((((((.....))))))))))....)))))))........)))((((.((....)).)))).................))).)))).....)))))......))))).....))))))))..(((((((((((.(((((.....)))))))))))).))))(((((.........))))).........)))))))))).......)))))))((((.......))))....))))))..)))).............((((((((((.(((.((((....((.(((((((.(((.(((.((((.(((..((((((.........))))))..)))..))))..)))))).))))))).))....))))..))).)).)))))))))))))......)))).)))...))))........))))))...))).)))))))..))))))...))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({(((((((((..,(((.({..........||..,,,{{.........))...................,,,,,{{.,({({((((((,,..}}}},,,|||||,||}||||,,.........|||||}}{...{,.....,((,..(((({(,,(((((((,{({,(((||.|||,..((((((......)))))),.(((((((((....))))))))).|||||||{,.({((({((((...,,{||..,|}|||||}..|,...})),,.,|{{(((({{{{{,||||,,..,)))).,,,,(({(.((....||,||||{,{({(((....,,|||...||{{{{{{||||||||,...,,.....,}}|}|.}}.}|...}}|}||},,,..}}))).,,|||||,.{{{{{{|,..|(((((.((((({(((((.((((((.......((......))........)))))).)))))...},.,))))..)))))................(((((.....)))))......((((((((((......,,.........{{{{(({|..{,..,..,|||((({{.((({.(((((.,||||{(({{(.{{,,....{|||{||..{|{(((((...(((.(((((((((((.(((.........))).))))).....)))))).}})...,,))),{||||{,...{,((({,{{....)}}.,}}|},{,||..}}||{||{,,||||,,}}})))).,,)))|||...,}||||}|{((((((((,(({(((({.((((((..........))))))...}))}|((.(((...((((((((((((........)))))...)))))))...))).))}..|((((({....))))))|,,}}}))..((((....((((....)))}....)))).{(((((((((.....))))))))))....)))))),.........}}{(((.((....)).)))).................}),,..,,......}}})}}}.,,}}.....)})))))))))..(((((((((((.(((((.....)))))))))))).))))(((((,......,.))))).........)))))))))).......}}}))))}}).,,)),}})))),...,}},))},))))..........}})||||{(((((.{((.((((.,,.{{.{(((({(((((.{(((..(((((({{({,,,,.........}),))))))))..))}.,.)))))..,))}))).,,....))))..))).))))),})))})))}}......}},}.|||.{{|((({...)))))))}})},.)},.}}})))),.}})))}...))},..)
Forensic Context

No forensic context available.