Basic Information

Symbol
hsa_NFIX_0000800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFIX_0052
Host gene
NFIX
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:13135835-13186485 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:13025021-13075671 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-345.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -363.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 217.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((.((((....((((((....)))))).(((((((.((((.(((((((((((.(((....(((..((((....))))..)))......))).))........)).)))...)))).)))).))))))).....((.(.(.((((((((((.((.(((((...((.....))..))))).)).)((((((((.(((.(((((....(((....(((((...((((((..(((((..(((............((((.....))))....((((.(.((((((((...(((.((((..(((((((((((((..(((((...(((((...)))))((((..(((((((.(((((((((.((((..(((...........(((((...)))))....((((((((....(.((((((.....)))))))))))))))...)))..))))...).))))))))...)))))))...)))))))))......)))))))))..(((.(((..(((((((.(((.((((((.((((((.........((((((((.((((..(((((((.((........)).)(((((...))))).....))))))..).))).)))).)))))))))).)))))).))))))))))..))).)))............((((.(((....))).)))))))).........)))))))...)))))))).)))))........(((((((.(((......((((((((.(((.....))).)).............((........))))))))..((((((...........))))))....))))))))))))).)))))....)))))).))))).)))...)))))))))))))))).))))))))).).).))))))..))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,....,.|((((,(((({,,.((((((....)))))).(((((((.((((.((((((({({(,({,..,,(((..((((....))))..))}.,,,.....,,.})}}..,})).)))...)))).)))).))))))),,,..((,(.{.(((((((((,.,,.||||,...{{..,,,},..}|||}.})}}(((((((,{((,,(((((....(((....(((((...((((((.{((({(,,{{({,{,.....},,{(((.....))))....((((.(.((((((((...(((.((((,,(((((((((((((..(((((...(((((...)))))((((..(((((((.(((((((((.((((..(((.......,{{.(((((...))))).}},((((((((.,,.(.((((((.....)))))))))))))))...)))..))))...}.))))))))...}))))))...)))}}))))......))))))))}..(((.(((..(((((({,(((.((((((.((((((...,,{{{{(((((,,,,{,{{..{{,((({.,,.,,,,...},..(((((...))))).....}}}},,.))})))}))}),}},,)))))).)))))).))))))))))..))).)))............((((.(((....))).))))))))...,,,...}))))))...)))))))).)))))....,,..(((((({,(((.,..,.((((((((.(((.....})).)).............((........)))))))}..((((((...........)))))),.,})))))))))),,)})}}}}.,}.)))))).))))).)))...)))))))))))))))).))))))))),),),),,,),.,}}})}.}}..
Forensic Context

No forensic context available.