Basic Information

Symbol
hsa_chr19_0045000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFIX_0020
Host gene
NFIX
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
19:13184823-13188163 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:13074009-13077349 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-765.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -798.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 370.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.........((((.((..((((((.....(((((((((.((((((......(((....))).....))))))((......))....((((..((.(((((((((.(((((...(((((((((((((((((..((....((((((((((......)))))))...)))..))..))))))).((((......))))))))).(((.((....)))))(((((((..(..((((((.........))))))..))))))))..........((((..((...))..)))))))))...))))))))))).))).))..))))....((((((....((.((((......))))))..)))))))))))))))((.(((((((((((((((...((((.((((((..((((((((((((..((((((((((....))))))).))).(((((.(((..(((..(..(((((...)))))...)..))))))))))).((((((((((....)))))))))).(((((((((((........)))))..))))))......).))))).)))))).........(((.((((...(((((...((((..((.(((.((......))))).))))))..)))))..................(((..((((.((...)).))))..))).)))))))..((.(((.((((((...(((.(((.....))))))..)))))).)))))........)))))).)))).....((((((((((.....(((((((((.((((.......(((((((((.(((((.(((.((.(.....).)).))))))))((((((......(((((((....))))))).......((((......))))......(((.....))).....((((((((..(((((.((((((..(((....((((.((((((((((((.((((...(((.((.((((....((((...(((((.....)))))...)))))))).))))))))).)))))))))))).......((((.((((((((..(((.....(((((..((((((.(((....(((...)))))))))))).))))))))))))))))))))(((((((((((((.((......((((....))))(((((((((...)))...))))))......((((((...(((...((((((((((((.(((((((........(((....))).((((((........)))))))))).))))))))....))))))).)))..)))))).)))))))))))))))...........))))..)))...)))))))))))..).)))))))......)))))))).))))))))))))))))))))....))).)))))))...)))))))((........)).......)))))))).))((((.......)))).))))))..)).)))).))))).((((((((((((...(((.((((((...((((......)))).))).)))...)))((((((...(((((((....))))).((.((((((((...)))))))).)).........(((((......(((((.((((.......)))).)))))....))))).))))))))(((.(((.((((...((((..((.((.((.((.(((((....))))))))).))))..))))(((((....))))).............((((((((((((((...........))))))....)))).))))))))))).))).))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((({(.,{.((((((..,..{((((,(((((,(((((,((.,,{||({..{{{((({,..|||{{,..||||||((((....))....((((..((.(((((((((.(((((...(((((((((((((((((..((....{(((((((((......))))))}..,)}}..))..))))))).((((......))))))))).{((,{(,..,||}},{((((((..{..((((((.......,.))))))..})))))))}}.}}.,,,,((((..{,...}}..)))))))))...))))))))))).))).))..))))....,(((((..,.((.((((......)))))).,))))))))))))),,{((((((.(((((.(((((...{({({...((..(((((((((((,..((((((((((....))))))).))).(((((.(((..(((,.{..(((({...}))))...)}.))))))))))).((((((((((....)))))))))).(((((((((((........))))),.})))))......}.))))).))))))..))...}})),)))))..))))).)))).))}((((.{{{((......)})}.,}))))...(((({......,))))......{((....})|{{..{((((.((....))..)))).,..||.(((.((((((...(({{(((.....))))))..)))))).)))},...(((....))).})))))}...((((((((((.....(((((((((.((((.......(((((((((.(((((.(({,((.({....)}}),))))))))((((((......(((((((....))))))).....,.{{{{......))))....,,{{{.....})).,,..(((((((({.(((((.((((((..,,...{,{.(,.((((((((((((.((((...((,{((.((((....((((...(((((.....)))))...)))))))).))))))))).))))))))))))..}})),{{{,{((((((((..(((.....(((((..((((((.(((....(((...)))))))))))).)))))))))))))))))})}(((((((((((((.((...,,.{(((....)))|(((((({{(...}}}...)))))),...({((((((...(((...((((((((((((.((((((({.......(((,...})).{(((((.,......)))))))))).))))))))}...))))))).)))..)))))).))))))))))))))).,.({{{{({....})))))...))))))}))))}})}}})))))......)))))))).))))))))))))))))))))....))).)))))))...,,,,))))),}}}..}}}}}}}..}}))),)}}|((((.(({...}))))))}..)))))))),}},).))))).((((((((((((.(((.({(((({({({((((,....,)))))))),}))...{{{((((({..,({(((((....))))).{{.((((((((...)))))))).}}.........(((((,.....(((((.((((.......)))).)))))..,.))))).})))))))..}}},,,((,,...,.||||{,.((((,.(({(,((({{..,||||,,,)}))}}..})))),)}}}}})).,.,.....,,(((({.,((,((((((((((...........)))))}...,)))).))))))))})).))).))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.