Basic Information

Symbol
hsa_chr19_0045200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFIX_0043
Host gene
NFIX
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
19:13184823-13201131 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:13074009-13090317 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-274.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -284.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 86.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((....(((.(((.((((((((((.((((..((.((((...((((((((((.((((............((((((.((((...((((.((.....(((((((((((((..((((((((((..........(((((.......)))))..)))))))))).))).))))))))))))))))(((((.((((.((.(((...((((((...((((((((((..(((((((((......).)))))...(((.(((((((((.((((...)))).))))))))))))...)))..)).))))))))..))))))(((....)))))))).)))))))))))))))))))((((((((.((...((((((.(((((((((((...(((..(((..((((..((((((........)))))).(((((..((((.(((((.((((.....)))).))))).)))))))))))).)..)))..)))))))))))..))).))))))....))))))))))..))))))))))))))........)))).)).....)))))))))..))))).))))))...)))...))))))((.....(.((......)).)....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((....((,{(((.((((((((({{((((..(({({.,{.{((((((((((.((((............((((((.((((...((((.((,....(((((((((((((..((((((((((.........,({(((......})),))..)))))))))).))).))))))))))))))))(((((.((((.((.(((,..((((((...((((((((((..(((({((((.,....,.,},}},,}{||.,((((((((.((((...)))).)))))))))))),,,}}}..)).))))))))..)))))){((....)))))))).)))))))))))))))))))(((((((,{((...((((((.(((((((((((...(((..(((..{(((..((((((........)))))).(((((..((((.(((((.((((.....)))).))))).)))))))))))).}..)))..)))))))))))..})).)))))),...))))))))))..)))))))))))))}}}.}....)))).,,.....)))))))))},,)))).))))))...)))...))))))((.....(.((......)).)....))
Forensic Context

No forensic context available.