Basic Information
Symbol
hsa_NFIX_0004600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NFIX_0026
Host gene
NFIX
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:13206387-13207654
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:13095573-13096840
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-588.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-611.54 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
360.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(......)((((((((((.((.(((((.(((((((((((((..((((......))))..)))..))).))).))))))))).))..))))..(((((.(((.(((..((....)).((((((....))))))((.((.(((..((((((.(((((.((((((((((((((..(((..(((((((((((..((((((((...((((........((((((((...))))))))........))))....))))))))(((.((((((((((((...(((((((...(((((.((((((.(((.((((((((((..((((......))))..)))))))).)).))).)))))).(((((..((((..(((....)))..))))....)))))...))))).....))))..)))...((((((((.(((....(((((((((((.....((((....)))))))))))))))......(((((((.((..((..((..(((((((.((((((((.(........).)))..))))).))))))).))..)).)).))))))))))...))))))))((((((((((((.....(((((((..(((.(((((((((((((...((((.((..((((((((((.(((((((((((..............(((((...((((.(((((....)))))((.....))..(((.((.((((......)))))).)))..)))).....)))))...((((((((.(.(((....)))))))))))).))))))))))).))))))))))..))))))))))))).)))))).)))((((((((.((((((((((((.....)))))))).....))))..((((((...))))))))))))))(((.(((((((((.(((..((.(.((...(((((.((((((((((((.((...)).)).))))))...))))..))))).)).).))))).))))))))).))))))))))))))))))))))...)))))))))))).)))(((((((((((.....((((.......)))).......(((((((((...(((((......))))))))))))))((...))...((((...)))))))))))))))(.((((...((((((((....))))))))...)))).)...)))))))..))))....)))..)))))))))))))).))))))))).))..)))..))))..))).)))))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(......)((((((((((.{{.(((((.((((({(((((((,.((((......)))),})))..)))).)).))))))))).))..))))..(((((.(((.(((..((....}}.((((((....)))))){{,{,.(((..((((((.(((((.((((((((((((((..(((..((({(((((({,,((({((((...(((,{,,.,,,.,{{(({{,...,}}})))},..,}.,,))))},},)}}}}|||((({({((((((((((...(((((((..,(((((.((((({.(((.(,(((((((({((((((.....)))))))))))))).),.))).}))))).{((((..((((..(((....)))..))))....))))}...))))}.,,..))))..)}}..,((((((((.{({....(((((((((((.,.{{({{{....))))))))))))))),..,.(((({(((.({..{,,,|{,,{{{({{{.{(((((((.(...,....}.}))..))))).}))}))).)),.)),})}))))))))),.,.))))))))(((((((((((({,{{{({(,(((({((({(((((((((((((...((({{((..((((((((((.(((((((((((....,.........((({{,{.((((.(((({....|}})}||,....}}..(({.((.((((......)))))).})),.)))).},..}))))...((((((((.(.(((....)))))))))))).))))))))))).))))))))))..))))))))))))).)))))).}}|((((((((.{{({((((((({.....))))))))..,,.}}}),.{(((((...))))))))))))))|((.(((((({{(.{{{..{{.{.{|...||{{{,(((((((((({(,,,...}},|}.))))),..,)))),,))))),)).},))}}}.)))))))}).}})))))}),))))))))))))...)))))))))))),)))|,|((((({(({...|||.|,}}}...,|||...,..,(((((((((...(((((......))))))))))))))},,..}},,,|||({{{|||,,,,||||||||(.((((...((((((((....))))))))...)))).,,}}))),))).)))))}}..)))..)))))))))))))).))))))))).))..)))...})),.))).)))))))).))))))
Forensic Context
No forensic context available.