Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0003300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0003046 hsa_circNLGN1_002 hsa-NLGN1_0004
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:173322069-173322881 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173604279-173605091 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-211.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -227.45 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.