Basic Information
Symbol
hsa_NLGN1_0015700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0122753
hsa_circNLGN1_009
hsa-NLGN1_0003
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:173993105-173998851
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:174275315-174281061
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-411.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-444.18 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
315.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((.......((((((((((((((((.....(((((((.((.(((.(((............(((((((((((((...(((((((.((.((...))))..)))))))..))))))))...))))).(((((((((..((.((((......))))..((((((((((.((...((((....((((((....))))))((((((.((........((((....))))...((((((((((((.........)))))))).((..((((((((((.....))).))...)))))..))...(((((((((.(((((((..(...(((..(((((.((((.....))))..(((....)))......))))).))).)..)))))))))))))))).....))))..)))))))).))))..)).)))))).))))......))...)))))))))...)))))))).)))))))))))))(((....(((((...)))))....))).(((((((((((((((.....((((((....((((.((((..((((((((((((....(((((((((((((..((((...((((((........(((..(((((.((((...((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))))).......((((.((.....))))))......))))))..))))..))).))))))))))........((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....((((....)))).....))))))))))))....(((((.((((.(((((((((((((...)))))))(.((...((((((((((......((((....))))..((((((.((...((((.((((((.(((.((((((.(((((((((.((((......((.(((((((....))).)))).))...(((((.....((((((((......)).))))))....)))))........))))))))..............))))).)))))).))).)))...))))))).............(((((.(((....((((.......))))))).)))))........)).)))))).))).)))))))...)).))))))).)))).)))))..................))).).))))......))))))..((((((...((....))...))))))..(((.(((.((((....)))))))...))).....)))))))))).......(((((((((.(((..(((.........(((((((...)))))))(((.(((((.(((((.......)))))))).)).)))..)))))).)))).)))))(((....)))..))))))))))))))))))))))).))).........((((.((((((((.(((...((((.(((.((.....)))))...)).)).(((........)))...........))).)))))))))))).....)))))(..(((((....)))).)..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((({......{((((((((((((((((.....(((((((.((.(((.(({..........,.((((({(((((((.,.(((((((.((.((...}))),.))))))),.)))))))}...))))).(((((((((..,{.((((......|}}},.((((((((((.((...((((....{(((((....)))))|((((((.({........((((....))))...((((((((((((.........)))))))).....{(((((((((.....))).))...))))}},}}...{((((((((.(((((({..|...{{{,,{{{{|.|{{|...{,||,}..,,|..,,}}}.,....}}})),))),}..}))))))))))))))).....}}}},.,}))))))}))))..)).)))))).))))......,,...)))))))))...}))))))).)))))))))))))(({,{{.(((({...}))))..}}))}.(((((((((((((((.....{(((({....,,,,,{{({..((((((((((((....(((((((((({((..((((...((((((......,,,,{,{(((((.((((.,.((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))),,.....,.((((.((.....))))))......))))))..))))..})).))))))))))..,.....((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....|{{{....,,}).....))))))))))))....(((((.((((.(((((((((((((...)))))),,{{{,,.((((((((({.....,((((,,,.}|||..{{(({{.{{...{,{{{,,,(((.(((.((((((.((((({((,{((({...{{,((.(((((((....))).)))).))...,{{{{.....((((((((......)),})))))....}}}}},..,....}}},))},.............}))))).)))))).))).)))...},,}})),,,}.........(((({.{((....((((.......))))})).}}}}}.,,.....}}.|||}}}.})).}}})))),,,}}.))))))).)))).)))))...........|||....,,},}.}},...,,}})}}}},..{(((((...((....))...))))))..(((.(((.((({....}))))))...))).....))))))))))..,....{((((((((.(((.,{{(..,......(((((({...})))))),...{|(((.(((((.......)))))))).)).}}}..}}}))}.)))).)))))|||....,,},.))))))))))))))))))))))).))}.........((((.((((((((.,((,..((((.(((.((.....))))).,.)).))..||,.,....,|,|...........)),.)))))))))))).....)))))(..,((((....)))).)..)
Forensic Context
No forensic context available.