Basic Information
Symbol
hsa_chr3_0373300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0127
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:173134656-173135434
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173416866-173417644
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-127.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-144.15 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
185.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((...(((.(((((((..(((((((..........(((((((.(((.....(((...((((((...))))))...)))......))))))))))..)))))))..))).)))))))))))))))((((.(((((......(((((((.....(((..(((((....)))))..))).....))))))).......(((((((((....))))))))).....((((((((..((((((((((..((((.((((.....(((((((((...)))).))))).....))))))))........))))))))))...(((((..........)))))..........))))))))(((((..(((....)))....))))).((((((((((.((((((((.......((((.((((((.(((....))).))))))))))(((((....)))))...........((((((((((.((..((((((......)))))).)).)))))))))).((((((...((((((((.(((((...))))).......((.(((((((.......))))))).)).....))))))))..))))))...))))))))..(((((((((((..(((....)))..))).................))))))))((((((........))))))......((((......(((.(((((.(((.....))).)))))))).....))))....))))))))))........)))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({,{,{...,,|}|||({{{..(((((((..........(((((({{(((.,,,,(,,...((((((...))))))..,))),,....)))))))))).,))))))}..}}|{||||,,,,.,.,)))|||{.{{{{,...,,,{{({{{(,..|,{{{..(((({....)))))..))),..,,})))))}..{{{{{((((,,,,...}}))))))))).....((((((({..((((((((((..((((.((((.....(((((((({...,))}.))))).....))))))))........)))))))))).,.(((((..........)))))..........}))))))),,,,,..,,{{{||||||,..,,,,,.((((((((((,,(((((((.......{(((.((((((.(((....))).)))))))))|(((((....))))),..........((((((((((.{(..((((((......)))))).)).)))))))))).((((((...((((((((.{((((...))))}.......{{.(((((((.......))))))).)}.....))))))))..))))))...)))))))),||{{{{,,,,,,..(((....)))..,,,...,,..||}}|||.,.,}}}}}},{(((((.,.....,)))))}......|||||,,.,,|{{.(((((.(((....,))).)))))}}}.,,,.},,,....}}))))))))..,...}}))}}},..}}})
Forensic Context
No forensic context available.