Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0004300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0022
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:173322076-173322881 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173604286-173605091 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-207.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -226.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 303.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((......((((..........(((......)))((((((..((((...((((((.(((................((((((((((....))))))..)))).......(((((((........((((((((((((((.((((....((((....(((((((((....((((((......((((((........))))))..(((........))).((((.....))))........))))))....))))))))).....))))....))))))))((((.(((.(((((((..((((...((.((((((((((....)).))).)))))))..))))))))))).(((((((((((((((..(((((((((((((((...((((.((((...((.....))....))))..((((.....(((((((...((((....))))......(((((((((...(((..((((((..........(((((...(((((((((.(((..(((..(((((..........))))).))).))).))..)))))))...))))).........))))))...)))..))))))))))))))))...))))))))...))))))))..).))))))..)))))).)))..))))))(((........)))...........(((((...)))))(((((...))))).))).))))...........))))).))))).))))))).)))))))))...).)))..)))))).(((((......))))).))))...))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.(((....,.((((,,.,{,{....{{,,.,,}))}((((((..((({,..(((((({(({.,,{.....,},....((((((((((....))))))..)))).....,,|||{{{{,|{{{,,.{({(((((({,,.,.{{(({{{{((((({{{({{({((((.{{{(({{,{{{|.|{((((((........)))))}..{||.,}},..,}}||{({{.,,,,,.|||.|{{{|{|,,,,,.,{,|||||,,,,......((.(((((((((((..(((((((..........{{{{.,,((.((((((((((....)).))).)))))))..}}}})))))))...))))))).)))).)).,(((((,((({,,,.}}||||}}}}}}}}|....}}))}}}.)))},.||.|||||}|{{(((((.(({((,,{{||},......{(({((((({{.{,{.{(((,(({{.{{{....|||,,...,{{((({((.(((..(((..(((((..........))))).))).})).))..})))))|{{{||,|,...}.))))))}}},...))}|,|}}}}))}}}})))),}}}),.}))}}}}})))||||,..||||||||..,|||||.||,,,,,}},,}}}.}})}}.}))).......,}))))))}.}},))))|,|||,,,}}}))}})).))))}},}.......})))}.))))),))))))).)))))))))...).)))..)))))).{((({......))))).}}}}.,.))))))...
Forensic Context

No forensic context available.