Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0073
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173356056-173356699 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173638266-173638909 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-142.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -156.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 148.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..((((((((.(((((.(((.((.....(((((..((((((((((((((.((........)).)))))))...((((.....)))).......(((((((..(((((....)))))...................)))))))((((((....(((((((((...(((..((((((((((...))))))))))...(((((((((((......(((((((((((((...)))))))))))))(((..(((..(.((((.(((...))).)))).)..)))..))).........((((((((.(((((..(....)..))))).)))))))).))))))))..))))))..)))))))))...))))))..))))))))))))....)))))))))).......(((.((((((((.(((((.(((.(((((....))))).)))))))))))))))))))................)))))))).))))))))(....((((((((..(((((.(((((((......))))))))))))...)))))))).(((((..(((((.......(((.((((((.....((((.((.....)).)))).))))))))).....)))))......))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({..,((((((((.(((((.((((.(.....(((((..(({({{{{((((((.((........)).))))))|,,.((((.....)))).,,|,,.{({{{{,..(((((....)))))...................}}}}|}}{{{{||,,,,((({{{{{,.,,|||.,((((((((((...))))))))))}.,{{{((((((((.....,(((((((((((({...})))))))))))}(((..(((..{.((((.(((...))).)))).|..)))..))|,........((((((((.(((((..(....)..))))).)))))))).}))))))}..})))}).,))))))))).}.))}))),.))))))})))))..,.)))),))))}...,.,.(({{((((((((.(((((.(((.(((((....))))).))))))))))))))))))).,,,............)))))))},})))))))(....{(((((((.{((({(.(((((((......)))))))})})),}.)))))))).{((((,,(((((....,,.(((.((((((..,,,,{{{.,,,..,}}}.,,},.))))))))).,,..))))).,,.,.))))))
Forensic Context

No forensic context available.