Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0005200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0145
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173361508-173362659 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173643718-173644869 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-392.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -412.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 308.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((...))..((((((.(((.(((((((..(((.......)))..))))))).))).....(((((((..((((...)))))))))))..(((((.......)))))......((((......))))(((((((......)))))))((((..((((((((.((((.(((((...((((((((((((((.........((((.(((((((....((.........(..((((.........))))..)..((((((.((((((((....(((.(((.....))))))....)))))))))))).))..((((((.((...(((.((...((((......))))..)))))..)).))))))...))....))))))).)))).(((((.....))))).((((.(((((.(.((..(((((((..((((((((......((((.......))))...((((.((((((.(((...(((((.(((....(((((.((..((....))..)).)))))(((((.((((.((...(((((((.((((.(((........))).)))).....))).))))...)).)))))))))..))).)))))((((((((((((...(((((((.(((((((((((((((.(.((((.((((.(((.(((((((..........)))))))(((((((......)))))))(((....)))...(((..((((..(((.((.........)))))..))))..))).......)))))))...))))).))))(((...)))..............))))..))))...))).)))))))...))))...))))))))...((((..(((((((.((.((((.(((((((((.((........)).))))).....)))).))))...))...)))))))))))....))))))))))))).))))))))...)))))))........))).)))))..))))....)))))))))))))).)))))))))...(((...((((((.((...........))))))))))).(((.((((..(((((.....))))))))).)))..(((((((....(((....)))...))))))))))))).))...)))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,({.,,||.{{(((((.{{{.(((((((..(((.......)))..))))))).|}}.,,.,(((((((..((({...,})})))))))..{{(((,......}}}},.|||{{((((......))))||{((((,.....)})))),((({{,(((((({{.{(((.(((((,..((((((((((((((.........{(((.(((((((.{{,..{{{{...{{(..((((.........))))..).}|,,,||}|{{,{||{,{,{(((.(((.,,..,})))}.},}})))))))}}||.|}..((((((.({.,.(({{((...{(((......)))}..)))))..)}.))))))...))},..))))))).)))).(((((.....))))).((((.(((((.(.((..(((((((..((((((((,,{,..{{||,,.....}}}}...({{{{((((((.(((.,.(((((.(((....(((((.((..((....))..)).)))))(((((.((((.((...(((((((.((((.(((........))).)))).....)))}|)))...)).)))))))))..))).)))))((((((((,,{{..,(((((((.(((((((((({{(((.(.((((.((({{((,.,{{({{,..........}||||||(((((((......))))))){||}||,.},...(((..((((..(((.{(.........}})))..))))..))).......)})))))...))))).)))}((,...})},.,,{.........))}},}})))...})).))))))).,.,}},,..))))))))...{{{,.{(((((((.((.((((.(((((((((.((........)).))))).....)))).))))...))...))))))))})}....))))))))))))).})))))))...)))))))........))}.)))))..))))....)))))))))))))),))))))))),..(((...((((((.((.....,,.,..}}})))))))).(({,((((..(((((.....))))))))).)))..{((((({,,,,(({....))).}))))))))}}}})},))}..})}}))))}},
Forensic Context

No forensic context available.