Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0068
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173376864-173377641 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173659074-173659851 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-164.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -179.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 171.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((((.((((((((((.((((....((((((((......(((((((.((((.....(((((((((....)))))....))))..))))..))))))).....))))))))....(((((((.(((((...)))))..)))))))..)))).)))...)))))))((((((...(((.(.((((((((((...(((((..(((.(((....)))...))).)))))....(((((((.(((.......)))..))))))).((((((.....(((((.((((...........((((((((((.(((((.(((((.(((((((((((......(((((.(((.(((........)))))))))))....((((((.....)))).))....))))))))))))))))..........))))).)........))))))))))))).)))))..)))))).((((.(((((...((((((((((((((........((((..(((....(((((....)))))))))))).((((.(((..((.((((((((....))))).))).))..))).))))..........((((((.........)))))).)))))).))....((((((((.....(((....))).......)))))))).)))))).))))).))))))))).))))).).)))...))))))...(((((.(((((........))))).)))))((((..((((....))))..)))).......))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{{{.,,,{{.((((((((((.((((....((((((((......(((((((.((((.....(((((((((....)))))....))))..))))..))))))).....))))))))....(((((((.(((({...,))))..)))))))..)))).)))...))))))),{{{{{.},||{.{.((((((((((.,.{{{{{,,|||,{{{....}||...}||.|||}}....{((((((.(((.......)))..))))))}.{(((({.{...(((((.((((...........((((((((((.(((((.(((((.(((((((((((......{((((.(((.(((........))))))))))}....{{((({.....)))).))....))))))))))))))))........,.))))).),.......})))))))))))).))))).})))))}.((((.(((((...((((((((((((((........,{((,.,,||}..(((((....)))))}}}||}}.((((.(((.{((.,{((((((....)))))},}}.}),.))).))))..,,......((((((.........)))))).)))))).))....(((((((({{.,.(((....)))..,.}},)))))))).}))))).))))).)))),,)}),}}})).},}}|||,||||||...(({((,(((((,{,.....))))),))))).,}},.}))}}}}.|||},,}}.,...,},,))),)
Forensic Context

No forensic context available.