Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0005700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0126
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173383060-173384480 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173665270-173666690 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-318.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -347.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 432.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.