Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0006200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0056
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173453762-173456353 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173735972-173738563 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-580.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -633.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 513.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.