Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0009000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0179
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173547044-173547772 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173829254-173829982 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-133.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -152.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 274.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((......(((.....(((((((.((((....)))))))))))..))).....)))))))).((((.((((((((.((((.(.((((((((((((((..(((((..((...........))..)))))))))))))).)))))...((((((.....)))))).......(((((((((((((..((((.(.....).))))...))))))))))))).((((((...)))))).........(((((......((((((................((.((.(((((.(((((((((((.(((((.(((.((((((((((((...((.(((((.((.((.....)).)).))))).))............)).)))))...........))))).)))))))))))))))..........((((((...(((.........)))))))))))))))))).))))((((((((((((.((((.....)))).((((((......))))))..................(((((.((..((..................))..))...)))))((((........))))....))))))))..))))...))))))..))))).......).)))).))))).))).))))..(((.....)))...((((((.((((.....))))..).)))))....))((((((((.....))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((...{(.,((,{,,.(((((((.((((....))))))))))).,))).,,,,)))))))),((((.((((((((.((((,{.{(((((((((((((.,(((((,,((,.{,,,.,{,,||,,|}}}}}}}}}}}}}}.,}|}...,,{{{{,..,,}}}},,..,,,,.(((((((((((((..((((.(.....}.}))),..})))))))))))}.{(((({...|})))}.,,,,|{,,{{.{{.....,{{,{{{,,{{..,........,,,}||}|||{|,|||,|||{||||||{{{|{{{{{{({{{{{{{{{{{{({,(((({.{{,,,.,,,,.,.}}.))))}.,,.....,,.,,,.}},})))}.,,,,,,....|}}}|,})),))))))))))},,,,,.....{{{{{,..,|{{........,)))))))))))},,))))}},,.{{{|{{||{{{{.(({{{||,,},}}.|||||{,,,,,,)))}}}........,{{{{....,|{|||....}||||......,.........,|,,||...}))|}{{({.,....|||||||,..}}}}}}}),.}))}....,|))).,))|}},,}|,||}.}))).)))))}})}.))))..{{{.....}}}...{{{,{{.{{{{.,,,,}}}).,},))}))....))((((((((.....))))))))
Forensic Context

No forensic context available.