Basic Information

Symbol
hsa_chr3_0374800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0135
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:173586518-173587253 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:173868728-173869463 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-131.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -146.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 215.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...............(((...))).....(((((((((................................((.((((((..(((.((((.(((....))).)))).))).)))))))).(((((((((.(((((((..((((....((.(((((..((((((...(((((.((((...((((.((.(((.((((..(((((...)))))..)))).))).)).))))...)))))))))(.(((......))))............((((..((((.....((.....)).....))))..))))..))))))..))))).))....))))..)))))))(((((((........))))))).((((.(((((((.......))))))))))).......)))))))))..(((.....))).....((((....((.(((((.(((((((.((...........(((((((...((((..(((((......))))).....))))...)))))))(((....)))............................))))))))))))))))..)))).......(((((...)))))...))))))))).)))((((......(((.....)))..(((.((((((((((((((.....)))))..))).............)))))).)))(((((..((....((((...))))...))..)))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.....{{{,,.....,,{{{...))}.....|||||.{{{,,.......................,,,....{{.((((((..(((.((((.{{,....}}}.)))).))).))))))}},{(({((((((((.,(.(((({......|((((((......(((((......)))}}(((((((((,{{{{{(,,,,,|||||.,,||||},,|||}{{{{{{{{{{{{.,..,,,{{(({,.{,,.{{{{{|({{{{,,........{{{{..({{{..,{|{|.....}|||},.})))..))}}.........,},))))).))))})))}})},},)))))))))}}.........))))))))).,||||||..,.{{{||||,||{...,,,{,,{(({.....)))}.,,...,)}}.....((((....((.(((({{(((((((.({...........(((((((...((((..(((((......))))).....))))...)))))))|((....))}............................))))))))))))))))..))))...}}).)}}}}},})))).}..))))))))}}))}{{(({,,..|{{{.....))).,,||.,{{{,,{{{(((((.....)))))..))}|||.......,,,}}})}}}))}(((((..((....((({...})))...))..)))))}.,.,,
Forensic Context

No forensic context available.