Basic Information

Symbol
hsa_chr3_0377400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0131
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:173818982-173820717 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:174101192-174102927 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-356.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -395.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 477.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..........))((......(((.(((.((((((((((..((((((((((.((((...(..(((((....((((((.((((..(((..(((.......))).)))..............((((((((((((((..(((((..((((((..(((((...(((((((.((.(((((......(((((((.((((....)))).)))))))))))).)).))...)))))((((..((((((...............(((((...)))))..))))))..)))))))))....)))))).....)))))(((((((((......))))..)))))...............(((((((((.(((((..(((..(((((((((.((...((((..(((....((((((......))))))....))).))))....)))))))))..(((((((..(((((...((((.(((.....(((((((.......((((((((.(((.(((((........))))).)))(((........))).((((((....))))))......(((((....)))))..(((((.((((((..((((........((((((..((......))...)))))).......))))...)))))).)))))..........))))).)))......)))))))..((......))))).))))....))))).(((((((((...................)))))))))...)))))))..))..))).))))).))))))))).....(((((....)))))))))))))))))))........((((......))))(((((((......).))))))......(((((.(((((((((.(((.....))))))))))))))))))))).))))))...)))))..)...)))))).............((........))((((((.(((...((((((.(((((((((((.((((((((...(((.....)))..))))).)))...)))))............((....))))))))...))))))...))).)).)))))))))))))))))))...........(((((((.......)))))))((((((....((((..(((((........................))))).))))......))))))....(((((((((((.((((((.(((((..((.(((..........((((.((((((....)))))).))))....(((((....((((....))))......)))))(((((.((((((.((((((((((((((..((((((...)))))))))))...........((((((.......(((((((((((..(((((.((((.((((....(((((((((((((((.(....)))))....))))))...)))))...((((..((......))..))))...............)))).))))(((((....))))))))))..)))....))))))))))))))))).))))))..)))))).)))))))).))..).)))).))))))............(((((......))))).(((((((....))))))).............((((....))))..((((.....))))...........)))))))))))..(((......))))))))).)))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.........}}{{.{{{{,,{,...{(((,(((((((..(((((((((,.((((...,..(((((....((((((.((((..,{{.,({{.......})).)},.,....,,,.....((((((((((((((..,,{{,..,(((((,,((({..,,(({{{,,.((.(((((......(((((((.((((....)))).)))))))))))),}}.,....,,}||{{({..{{(((({{{{{..{{{,..({{((({.,,|||}},.,}}}||{{|||,,|||,....|||}}|,{{{.|||,|(((,,((((......)))).})))})},|}},...,.....,{,{,{{{{,,{,{{{,{{.|||,||||,||}}}}}.{((({........{{{..{||||||})|||}|||,||||}}..|}}}|||||{{,...,,{{{||,,||}||},,||,,.,|,,},,...,,,{{,||,|||||,||,,,.|||,||,{{,,,,...,}}}}||||,,,,......,,))}.{(((((....)))))){{{{{.(((((....))))}..,,|||}|{{{{{..{{{,..{{{{.||{{{{{||||......)),,,)),})),)}})))}}}},,.}))))|{||,|{{{{{.......,)))))))))),}..,,,,.......,}|||)))}},}.,...(((((.,.(((((((((.,.................)))))))))...))))).......||||{|,},.....,,))))},,,.{{{{|,,,,))))}))))))))))))))...,,{{,,{{{......}}||{{{{{{{......)},))}},})}}}.(((((.(((((((((.(((.....))))))))))))))))))))).))))))...)))))..,...)))),,.............,{........)}{(((((.{{,...((((((.(((((((((((.((((((((.{.(((.....))).,))))).)))...)))))............((....))))))))...))))))...}}}.)).)))))))))))))))))))..,}},....,|||||{{,......}|}}}||{{{{{{....((((..(({((.........,....,,,},.....,)))}.))))...,..))))},....{((((((((((.,{((,({(((({..,({((({{,.......((((.((((({....)))))).)))}..,{(({,({,..({{(.,..})}}.,,........{((((.((((((.((((((((({((((..((((({...})))))))))}.,.,,,,...,((((((,......{{{((((((((,,(({{{.{{{|,||||,,,.(((((((((((((((.(....})))}....))))))...)))))...,,||..,,.....,}}},}}))},.....,,,.....)}}}.}}}|(((((....)))))}})))..}}}....))}))))))}}}},)))}}}))))..)))))).)))))})),},....}}}).}}}..}}}}}}}}.{{{{({{{{...,,,|||||.(((((((....))))))),}}}}}}.,,..}}}}}.,)})))).,|{{{.....)}}}.........,.))))))))))}..|,,......,)))|,,,,.,,}....,)
Forensic Context

No forensic context available.