Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0015100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0204
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173854410-173855357 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:174136620-174137567 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-204.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -223.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 214.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((.(((...(((........)))....))).))))).((((....)))).(((((((((..(((....)))))))))))).....(((((....((((((........((((((...((((((....(((((.....(((((((..(((((...((((((((((.((..(((..........(((((...))))).....)))..)).))))))))))...).)))).((((...(((((((((((((((.(((((((.((((........)))).))))))).)))))).............)))....))))))...))))...........(((((.((((((...........)))))))))))...)))))))....))))).....((((..................))))...(((((((...(((((...))))))))))))...)))))).....))))))...(((((......((((((....((....)).))))))....)))))....((((((((....(((..(((((((..........(((....)))....((.((((.((((((........))))))..)))).))...(((((((..((((((((((..........)))))).)))).)).)))))((((((....)))))).)))))))...)))))))))))....((((.((((((((...(((((((....)))))))...........((((((......)))))))))))))))))).....(((((((....)))))))..))))))..))))).)))((..(((((((((((((((((.((((......)).)).))))))))))).....(((.(((((...(((((((((.....((((....))))))))).))))...))))).)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,{{((({((,...,,{.,}}}}}.,)),,..|||,}||,}.{(((....))}}.(((((((((..(((....)))))))))))).....{{{{,....|{({{{,,,.,{{,(,,((({(.(((((({.,.(((((.....{((((((,,(((((...((((((((((.((..{{{..........{{{{{...,}})).....}})..)).))))))))))...},.,},.((((...((((((.,,((((((.(((((((.((((........)))).))))))).)))))}.....{{.....,))...,.))))))...))))...........,{{((.((({{,...,,......}}}})))))))...})))))}....))))).....((((..................))))...{{{{{{{..,(((({...)))))))))))}...}}}}})..,..))))))}})))),,.....{(((({(,,...(,....,.,)),}),,}})))}}|||,((((((((....(((..(((((((.........,(((.,..((({......)))}.,||||{,,,{{{,.,(((,,..))).})},,,{((((((..((((((((((,,....,...}))))).)))).)).))))}{{{{{|....})))}}.)))))))...)))))))))))....(({{,{{((({((...{{(((((....||}|}}||,......,.,||||||,.....,}}}}}))))}}}}}}}}.....(((((((....)))))))..})))))..}}}}),))){,,,(((((((((((((((((.((((......))},).))))))))))}.....{({.(((((...(((((((((.....((((....))))))))).))))...))))).}))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.