Basic Information

Symbol
hsa_NLGN1_0015400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0168
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
3:173926112-173926670 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:174208322-174208880 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-124.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -136.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((..((((..((((((...(((((((...))).))))...)))))).))))........(((.(((((......((((.(((((.(((.((....))))).)))))...))))...))))).))))))...))))).......(((((((((((.((((((....))).))))))...))))))))...((((..((((((((((((....))))))..((((((....((.((((((.((.((.((.(((((((.((((.............)))).)))))))..(((.(((((....))))))))......)).)).)))))))).))))))))................)))))).........(((....))).))))...(((((.......)))))....(((((...(((...(((((((....(((((((.((((((..............))).)))..))))))).....))))))))))))))).((((((.(((((((((.((((.(.(....).).)))).))).)))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({(((,.(((({.{(((((...({(((({...})))},}}...)))))}.,}}}.......}|||},|||,}}},..((((.(((((.(((.({....)}))).)))))...))))...,,,,)})||,||,{{|||||....,..(((((((({{,.,,{({{,,{...,})))})},.,)))))))}.,,(({{..((((((((((((....))))))..((((((....{{.((((((.{{.((.((.(((((((.((((.............)))).)))))))..{({{(((((....))))))))......)).)).}})))))).))))))))................)))))).......,,||.....|||{|}}}...(((((.......))))).,..|||||..,({...{(((((((....(((((((.((((((..............))),,))..))))))).....)))))))),})))))}|||||.((((((((((.((((.(.(....).).)))).)))}})))))),)),)}
Forensic Context

No forensic context available.