Basic Information
Symbol
hsa_NLGN1_0015900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN1_0170
Host gene
NLGN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:173996651-173998851
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:174278861-174281061
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-333.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-362.06 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
391.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((...((((....))))(((((((((((((((.........)))))))).(((((((.(((((..(((((......)))))(((..........(((((..((((..(((.(((.((((((...((((.....))))...........(((..((((.(((((((...((((.....((((((((.(.((((....((((((((..(((((((...(((((......))))).........((.(((((..(((((((((((((....(((.............(((.(((.((.((.((.((((..(((.....(((((((................((((((((((((....(((((((((((((..((((...((((((........(((..(((((.((((...((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))))).......((((.((.....))))))......))))))..))))..))).))))))))))........((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....((((....)))).....))))))))))))..))))))).....)))....(((((((...)))))))((....))..((((((........)))))))))).)).)).)))))))))))...)))))))))......))))..))).)).))((((((.((.(((((((....))).)))).)).............((((((((......)).))))))...(((((((............................))))))).....))))))(((........)))............(((((.(((....((((.......))))))).)))))...)))))))..)))..))))).......))))).)))))))).....))))........)))))))...))))..)))...)))))).....((((((((...((....))...)))))).)).......((((....))))))).)))..))))))))).........)))..))))).)))....))))...........)))))))...(((((((..(((((.(((((.......)))))))).....(((.(((((.((..((((.((((....(((((((.((.(((((.....(((...........)))...)))))...)).))))))))))).)).))..)).).)))))))......))..)))))))............)))))))...(((((....(((((((.(.......).))))))).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((...((((....))))...((((((((((((.........)))))))).....{(({((((((.....}}}.|}...}})}|}}}}...(((((((((.(((((((..{...(((..(((((.,((,.,.{{}|,}...,|..},,}}.},...})))).))).,..)))))))))))))))),,,,..((((...((...))...}))),|||.(((((......}))))..,,....{({....,,..}||.(({,{({((,,.,|||..,,.,.......||||{({.{{.,,.{,.((((({((({{...,,((((({......,..,,,,..((((((((((((....(((((((((({((..((((...((((((......,,,,{,{(((((.((((.,.((((.((((((....)))))).)).))..)))))))))),,.....,.((((.((.....))))))......))))))..))))..})).))))))))))..,.....((((((....(((((((..((.(((((....)))))))....))))))).....)))))).....|{{{....,,}).....))))))))))))....|||||.{{({,(({{{{(((((((...))))))},{|,..,{{{((((((,......,|||}}}}))),,},||{||,||,,,|||,,,|||||,|||.{{{{{{.{{{{{,{{,,(({,{{,(({((,(((((((...,}}|,||||.}}...,,{{{.....((((((((......)),})))))...,|||||,..,....,,,,}},..............}))))).}}}}||.}}}.}|}...|||,}}},|||,....,,,,(((({.{((,...((((.......)))}}}|.}}}}}..,.....||.||||,,.|)).,,,})))}}}}),))))))),}})).})))).....,,,..,}},.,,,}}}}}}}}}..,,,)})}}}....{(((((...((....))...)))))).,|{,.(((.((({....})))))).,,}}},,,,,|}}}|||||}.{{{{.,{||||((((.{{,.,{{{,........(((((({...}))))))....{|(((.(((((.......)))))))).}}.,}|{,||||},,|}}},}|}|}||||,{{{{{{((,{{.{((({,,,,.(((...........)))...})))),,.}},))))))))}})}}},|||.||.,,,,)))))},.,,.,},|||,}},,...},},,....))))))}...(((((....(((((((.,.,....,).))))))).))))).}
Forensic Context
No forensic context available.