Basic Information

Symbol
hsa_NLGN4X_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN4X_0008
Host gene
NLGN4X
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
X:5947321-6071499 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:6029280-6153458 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-783.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -836.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 722.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((...(((((((.(((((.(((....))))))))))))))).......((..(((..........)))..))(((...((((((((.((((((((((((...(((...((((((...((..((((((((((...(((((.....(((.(((...)))))))))))..)))))))...)))..)).....))))))...)))....)))))))))..)))))......(((((.(((....))).)))))((((((((((.((((((((((((.(..........((((((......))))))...(((((((((.(((((................)))))....)))))))))....).))))))......((((((((((.((((((........(((((.(((..........))))))))(((.((((.........)))))))..(((((.((((.(......).))))..)))))((((((..(((((((((((((((...))))))).(((....))).....(((((.((((((((((((((((((.....((((((.((((.......))))..)).))))))))))))..........))))))))..(((((....)))))..(((((((((((((..(((((((..((((..(..(((((..((((((...................((((((..((..((......))..)).))))))(((((......))))))))))).)))))..)..))))..))).((((.((.(((((((((...........))))))))).))....((((((((((..(((((((((.(((.....(((...((((..(((((((....(((((......))))).....)))))))))))..)))..))))))))))))...........)))))))..)))............))))...((((...(((...)))..)))).........(((((....)))))....((((((((((((((((....))))).....((((((((((((.(((((.(..........).))))))))))....((((.(((.(((((...(((..((((((..(((((((.((((.(((((...........))))).....))))))))))).)))))).))).))))).))).))))...........(((((.(((.(((.((((((((....)))))))))))...))).))))).....(((((((((((...)))))))..))))(((..((((.(((.((.(((((((.((((((........................)))))).).))).))).))))).))))..)))....(((.((((((((((((.((((((((...))))((((((((((((((((((((((...((....))...)).))))))))).((((((..(((((((((((.(((((..........................))))).)).)))))))))))))))...((((((((((..........))))))))))...(((((.......)))))...((.(((.((((((((..(((((((((..(((((..(((((.((.((((((.((((((.((((........((((((..(((.(.(((....(((((.(..(((..((((....))))...)))..)(((((...((((((.(((((((..((((((((((((((..(.(((((((...))))))).)....((((((....))))))))))))..))).))))).....))))))).))))))...)))))(((((((..(((....)))....))))))).((((((.......(((((..(((((((((...........(((....)))..))))))....)))..))))).......)))))))))))..))).).))).)))))).))))))))).))))))))).))))).....)))))..))))....)))))...)))))))).))).))...))))))).))))(((..(((..((((((((((((((..((((........((((((((...............))))))))....)))))))))).......((((((((((....((((....))))...))))))))))...)))))))))))..))))))))))..))))))))))))...((((.((((.(((((.........))))).)).)))))).)))))))..)))))))))))...))))..)))))))))))))..)).)))))((((.....))))...))))))))..)))))).((((.(((.(.(((......)))).)))..)))).....(((((..(((((...((((..((..(((((((....(((((.(((((((((....).))).))..............))).))))).....(((.((....))))))))))))....))...))))))))).)))))((((((..(((.((((((.......))))))))).))))))..))))))..(((.(((.....))).)))..)).))))))))....)))))))))))).)))).))))))...))).))))((((.....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{((({{{(((((((.(((({{(((....))))))))))))))),...,|{({((((({((((..(({({,..{{{{{...,||||.{,.({{{((((((((...(((.{.((((((...((.,((((((((((...(((((.....(((.(({...}))))))))))..)))))))..,)))..)}.....)))))).,.}))....)))))))))..}})}},.{((((((((.(((....})).))))}}))))|,.{{{,{(,||,,.,},}}.}}}....{(((,.(((({{.{{{{..,,..{((((((((.(((((................}}}}}....))))))))}.....{{(((,,..{{{.{,,({{((({{((..(({{,,....(((((.(((,{,.....,,)))))))){{{.{{{{.....,{{{||,||||.{(((((.((((.{......,.})))..)))))}..}.}}}|||||},|((((({{..,}))}))).|||....,},...,||||,|}}}.|}})}}}.,,||||}}}}(((((((({,((({,.,,..,{((((((((.(((((((((.......))))))}})).)}.(((((....))))),{(,(((,,,|||{||}.(({(({..((((..(..(((((..((((((.,.....,,{,.{{..{{.((((((..((..((......))..)).)))))),,|}|.)}},.}}}},)))))).)))))..)..))))..))))),,,.((.(((((((((...........))))))))).)).{({(...(((.{...,,},))}...|}}}...,|},,..)))))}|,,||,|}}}}.|}|,}}}}}}}}}}.}}}}}),,)))},.{|{|||||||,.,|}|{||{{||||||,|..,}|.{{{....))}........,|||{....,}},,|||||...{{{{{{.{{...}},|||||}.{{{({{{,|.....,)))))))})))))}.,,||}}||||,,..,{||}}}))))}..}},}||||,.|||||||{((||{|||.,,,,..||||,|,..|||{{.,,((.,,(((((({((((((((....}))}.))))}..,})))}),))}.....,,}}|}}})|,.}|||,|{|||{|||}|{||}.|,||,.........|(((((.(((.(((.((((((({....}))))))))))...))).))))).,...(((((((((((...}))))))},}}))(((..((((.(((.((.(((((((.((((((.........,,....,,.......)))))).).))).))).))))).))))..)))..,,(((.((((((((((((,((((((((...)))){((((((((((((((((((({(...{{....},...}).))))))))).(((((({,,{(((((((((.((((({{....................}},.})))).)),}))))))))))))))...((((((((((..........)))))))))}...(((((.......)))))...{({(({..((((((..{(,(((,{(((((,,((((,((((.((.((((((.({((((.{{{{...,,,..((((((..(({.(.(((....(((((.(..(((..{(((....)))}...)))..}(((((...((((((.(((((((,.((((((((((((({,.,.((((({{,,.))}})}).}...,((((((....))))))))))))..))).))))).....))))))).))))))...))))){((((((..(((....))).}..))))))}.((((((.......(((((..(((((((((...........{{{....}}}..))))))....)))..))))).......)))))))))))..))).).))).)))))).})))))))}.,))))))))})))))}),..)))))}})..}}..})))))...,)))),),.)}}.,,...))))))}.))))|||,.(({..((((((((((((((..{{{,........((((((((...............))))))))....,,},)))))),......((((((((((.,..((((....)))).}.))))))))))...})))))))))),||||}}}))))..)))))))))))).,,(({{.{,(({{{,{{{.,,,.,..)}},},}}|||})}}.)},}||||.|||{{|||,||.|||||||||,{((((.(((((((({{{{...((((.....))))....,||{,...,}}},}..(({{.(((.,.{{|,,....})),.})}..))}).....(((((..(((({...((((..{(..(((((((....(((((.(((((((((....).))).))..............))).))))).....(((.((....)))))))))))).,,.})...))))))))).)))))((((((..(((.{(((((.......))))))))).)))))).})).))))))))))).}},}))))}.},.}}.}}))))).,.)))}||,...))))))),)}}))})))),,}}..,,})((((.....))))
Forensic Context

No forensic context available.