Basic Information

Symbol
hsa_NLGN4X_0003600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NLGN4X_0036
Host gene
NLGN4X
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
X:6089159-6091838 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:6171118-6173797 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-756.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -806.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 704.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))((((.((.((.((((.(((.(((((((......(((((.......)))))(((((((((..(((.(((((........((..((((((..........))))))..))....(((((.((((((..((..((((((((..((((....))))..)).))))))..)).))))))......)))))((((((.(.((....(((.(((.(((.((((((((((((((((...))))))))))))...))))))).)))..))))).).)))))).............((((((((.........((((((.(....((((((((........))))))))....).))))))(((((.(((((((((((((((((((((.(((....))).)))(((((((.(((((..((....))....)))))..)))))))....(((.....)))...((.((.((((((((..(((..........((((((.....))))))........)))....)))))))).))))......................)))))))).((((((..(((((.....((((((......(((((((.((((.((((((..((((.((((((((.((.(((((....))))).))........(((((((.((........)))))))))))))))))(((((.(((.(((.((((((((..((((....))))..))))).....((((((((.....))))))))......((((((((((.(((((.((((.((..........)))))).))))))))))))..))).))).)))))))))))..))))...)))))))))).....((((((((((((((..(((((((((....))))..)))))((((((..(((((((((((((((((((((...((((((((((((((.(((((..(((...........)))(((((.....)))))..))))).))).)))).))....)))))..))))))))))).....(((((((((....((((..((((((((..((((((........)))))).........((((((((((((.((((.....))))..))))))))))))......))))))))))))..)))))).)))...............................((((((((((((((.((((....((((((((..(((((...(((((.......)))))....)))))...))....))))))..)))).)))......)))))))))))..........)))).))))))))))))....((((......))))...........))).)))))).))))))))))))))))))...))))).....)))))).......(.((((((..(..((((((.(((((((....)).))))).................(((((........))))).....(((((((((((.........((((..((.....))..)))).......(((((((((((..............))).))).)))))..............((((......)))).))))))))))).))))))..)..)))))).)...........(((.((((((....)))))).)))..........(((((.....((((((((((((((..(((((...(((((.((......)))))))....)))))..))))).(((((....))))).........((((..(((((....((((..((((..((((.((..((........((((((.(........)))))))......))..)))))).(((......)))(((.((((.((((....)))))))).))).))))..))))....)))))))))))))).))))..)))))..)))))))))).)))))))))))))((((....)))).......((((((((...(....)...))))))))......(((((((((..........(((((.((((.....)))).)))))..........)))..))))))...))))).)))....))))))))).......((((((((.......................)))))))).)))))))))).)))).)).))))))...(((((......)))))..................((((((.(.....((((.(((...(((((((((((((.((((.((((((.............................((((...((((((((((...(((((((((....((((.(((........))).)))).......(((((((......))))).)).((((....)))).))))...((((((.......(((((.....(((.((.......)).)))....))))).........))))))..)))))...))).)))))))...)))).........((((((((...((((......(((...)))....))))...))))))))((((((..........)))))).......)))))))))).((((((.....(((((...))))).....)))))).))))))))))))).))).))))......).))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,{{.|,{{{|.|{.{(.((((.(((,(((((({.,...{{((({,,(((({,{(({(((({.,..{{(.|{(|{{{.{{..,..((..((((((..........))))))..))....,}|..|}||||..}||..|.|||||}}}|(((....)))}{{|.|||||||(({{{{|{{{{{({(({,((((((((((.(.((...{(((.(((.(((,{(((((((((((((((...))))))))))))...})))))).)))..}}))}.).))))}||..........,,||{|{{{|.......,,|({{{{,{,...(((({{({.,,,,,..))|}})}}.,,,}.}}}}||(((((.(((((((((({{({{(({(((.(((....}}).)))(((((((.(((((..((....))....))))}..)))))))....(({.....)))...((.((.((((((((..{,,...,,,|.,|((((((.....))))}}}}....,.)))....)))))))).))))............,,,,,,....|}}||}|},((({{{.{(((((,,,,,((({((,,.,,{(((((({.((((.((((((..,{{,.((((((((.{{,((((({...,)))).})........(((((({{((........))))))))))))))))){{(((,(({,(((,{(((((((..((((....))))..))))).....((((((((.....))))))))......((((((((((.(((((.((((.((..........)))))).))))))))))))..))).,}}.)))))}))))),,)})),..)))))))))),{{{,((((((((((((((..(((({((((....))))..}))}}((((((..(((((((((({(((((((((,...((((((((((((((.(((((.,(((...........})){((((.....))))}..))))).))).)))).}}....))))){{|,,,,))),})}....((((((({(,.,.((((..((((((((..((((((........)))))).........((((((((((((.((((.....))))..))))))))))))......)))))))))))),.)))))).))).........}}}}}}}},.............((((((((((({{{.((((....((((((,{..(((((...(((((.......)))))....)))))...,}.,..))))))..)))}.})}......))))))))))}........,.)))).))))))))))))....((({....,,}}}}......,....)))}}})))).))))).))))},}}))))}},)))}},,}}.}}}}}}.,|,||,(,((((((..,..((({{,.(((((((....)).)))))........,,.......(((((........))))).....(((((((((((.........((((..((.....))..))))......,(((((((((((.........,....))).))).))))),.............((((,....,)))).))))))))))).))))}}.,},.)))))).)..,},......{{{.((((({....}))))).}}}..........{||||},,,,|||||{{{{{(((({.(((((...((((,,((......)))))))....)))))}})))}).(((((....)))))..,,,|,,.{({,.,{{{({....{{{{..((((,,({(((({(,{.....,...({({((.|||,,..},)))})}}..,{{..,.}))}})}|(((......)))(((.((((.((((....)))))))).))).,,,}..,}}},..,)))))))))))))}.)))}..})))),,)))))))))).)))))}})}})))|,||...,|}||...,{{,((((((((,..{....).,.)))))))).}}}..}}}}}.,}},.......,,,....,}}}}}..|,|,|||||||{{{,..(((,({{{{.,||,||},.}},,}))},.,}}))}|}}.,.,},...,|||||,||........,||,|...}}}}},.}},}||},.,,}}}))))).)))),)),)))})}..|||,,({{{,..,,)))}|,,,|}}}},,.....,}|||||||||...((((((({,..{((((((((((((.((({(((({{,.......,,......,.,...........{|{{...((((((((((.,.(((({{{,|....((((.(((........))).)))).......{((((((......))))).)},{{....((((.(({,....,})}.))))...|||{{.,.........{{,{{{{..|),})}..,},,|||......,}})})},)}.)))))...)))))))))))...}}}|.......,,|(((((((...((((......(({...}))....))))...)))))))|((((((.,......,.))))))},,,,,,|||||}|}||{{,,,.....},||,|,}}})})),,}))}}}}},..})))))))))))}.,......,,,.}}))})),,}))},}
Forensic Context

No forensic context available.