Basic Information
Symbol
hsa_NSUN2_0004900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0071759
hsa_circNSUN2_016
Host gene
NSUN2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
5:6620219-6621602
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:6620106-6621489
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-383.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-411.67 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
425.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......))))))(.((..(((((((((....((((((................))))))...))))))))).((((.(((((((((..((((.........(((((((((((((..............................(((((((((......)))))))))(((.((((((...)))))))))(((.....)))(((((...((((.(((.(((((((((.(((..((.......((((((.....)))))).....))))).)))))))))..)))....))))..(((((.(((...)))))))).(((((((((.......(((.(.(((...(((((((.(((((((..(((((((((..((((((.......((((((((..((((((((((.....)))).))))..(((((((.((.....)).)))))))...(((((.......)))))...))..))))))))..((...((((....)))).))...........(((....)))................((((((((((.((...((((((((((((..((.(((....))).))..))))).)))))))..)).)))..)))))))))))))..))))))))).))).)))).))..))))).))).))))......)))))))))....)))))...)))))))))))))......(((...((((((((.((....)).))...)))))).)))...((((.((((((..((((((((((((....((((..(((((((((((((((((.(((....)))..))))).((((((((..(((((((.((((((...............)))))).....((((((.((((((((((.((((........)))).))))))))))((((((((.((.......)).)).))))))..............)))))).((((((.....))))))..)))))))...)))))))).(((((((..((.((((((........))))))......))..)))))))......))))))))))))....)))))))))..(((.(((((.((..((....))..))))))).))).......(((......))).....)))))))...))))))))))......((((......)))))))).))))))))).)))).....(((((.(((((...))).(((((.(((((((........(((.(((.(..((....((((((((((.....)))))))))).....))...).))).))).........)))))))))))).(((((...))))).(((((.......))))))).)))))...)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((......))))))(.((..(((((((((....{{({{{.,,.,........,..))}}}}...))))))))).{{{{.(((((((((..{{({.........{((((((((((((....,,,,,,........,.,,....,,,,(((((((((......)))))))))|{(.((((({...}))))))}}.......{||((((.....,||...{(.(((((((((.(((.,,(,,...,.((((((.....))))))..,,,}.))).)))))))))}}}}|||}}}}}|,,{(({,.((({,{|||||||,.(((((((((.......,(({({((({{{(((((((.(((((((..(((((((((.,((({{,...,...,,,,,,{{,..(((((((((.....)))).))}}}.|||{(((,{{.....}},)}}}}}}...,{{{{.......,,,..{{{||||,}}}))))}})|...((((....)))).,,...,,......,,|,....}},.,.......,||,..|(((((({{(,((...((((((((((((.{((.(((....)))..)}}))))).)))))))..)).))}..))))))})))}))},))))))))).))).)))).))..))))).}))},,))}}})}}))))))))).,,,|||..,,,||||||}||||||.......((,,.((((((,(.{,,,..,),,,...)))))).}|,...(((,(((((({,,(((((,,,,,||}}}||{||||||{{{|{(({{({((((((((,,,.||,,,|||||,({{{{{||..{|||{{|,,,||,|}},,,|,,.,..,,,)))))},...,||||||,|{{||||{{{.{{{{...}||||||,},}||||||.}}||}))}}},||}}}}}}}})})),})))})},,,,,.,.,}},,)))}}|.{((((({...,)))))}.,))}}}||,,,|}}}}||}.(({{((({,...((((((........))))))......}}..,}}})}}......}}}}}}})))))....}}}}|||||.,(((,(((((,,,.,(({,..||,.||||||}{|||.....,,({{.|,|,.}}),....))})))}...)))))))}}).,.,..,,||,,,,,,)))))))}.|})))))}),))))...{,(((({.{,(((...}}}.{((({.{(((({|,.||||.,|||||{,,|,}||,.,.((((((((((.....)))))))))).,,,,)}.,.,.,,)})))..},,.,,,)))))))))))).{{(((...})))},|,{|{.......}},}}}}.})))},..)).)
Forensic Context
No forensic context available.