Basic Information
Symbol
hsa_chr5_0553100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-NSUN2_0029
Host gene
NSUN2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
5:6604274-6605300
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:6604161-6605187
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-185.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-199.39 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
200.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...))((.(((....(((......(((...((((((((((.((.(((((...............))))).))..........(((..((((.(((.((...)).))).))))..)))(((((((..(((((((..(((((.............)))))..)))))...((...((((..((((((((..................................((((.((((((..........))))))))))..((.((((.(......).).))).))..))))....))))..)))).))....(((((.....((((........))))...((((((..(((...(((((...))))))))..))))))(((((((...............((((.((((.......))))...))))..((((.((.(((...)))))...))))((((((.(((((.((.......)).))))).)).))))..)).))))))))))(((((.(((.((((((((..........)))))))).))).)))).))).....)))))))....((((((((((.(((((........)))))..))...........))))))))........(((((........))))).)))))))))))))...(((..(.(((....))).)..))))))..)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({,,{{((({(({{,,,......(((.{{((({(((((,..,.((,{(,..{{,{..{((((({{{,{,,,.......,,}}.}}},...,}}))}....,}}}.....{((((((((.{.(((.((((({(..(({((......,,.....}}}}|..}}}}.,,...,{,,,{{|{{,.,.|||||......,|,......................,|(((.((((((..........))))))))))..((.((({.{......},).))).)),}}.)))..))).}.))))).)))}..,,....,,}}|{{|,|,,.,},}}}},..||,,,|,|||.,,.(((({...})))),||,|||||||||,||}|.,,....,....,..{(({.((((.......))))...}))}..((((.((.(({...)))))...))))((((((.(((((.((.......)).))))).}).))))..{{.{({{{,,{,({((((.(((.((((((((.,.......,)))))))).))).)))).)),}..))})},,.,....((((((((({.(((((........)))))..}|,.....,,.,.))))))))........(((((........))))).)))))))))))|}{{{(({..{.{{,...,))),)..))}...})),..)
Forensic Context
No forensic context available.