Basic Information

Symbol
hsa_OGDH_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0080058 hsa_circOGDH_004
Host gene
OGDH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:44663916-44741214 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:44624317-44701615 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-966.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1016.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 563.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((...........(((((((((((.....((((((((((....((((((((((......))))))...))))....))(((((((...........(((((...(((..(((((((((..((.(...(((((......))))).(((.((((((((......)))))))))))((((....))))).))...))))))).))..)))..))))).........))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).....)))((((((((....))))........(((((((((((........((((.(((...)))))))((((((...((((....((((((.(((...((((.(((....((((.....(((...)))..))))..))).))))....((((....))))........))).)))).))))))...)))))).((....)).))))))))))).(((((((..((((((.((((.(((....((.........(((((.((.....)))))))))...))).)))).))))))(((((.....))))).....(((((((.((............))))).)))).)))))))(((((.....)))))..(((((((((((((((..((((((...(((((((.((((((((((((.((((........))))..((((((((((((.(((((.(((.((.(((((((.(.((...(((.((......(((........)))......)))))....)))))))))).))))))))))..)))..(((((.((((......)))...).))))).(((((.((((((((....(..(((.(.((((..(((..((((((((((.......((((((.......))))))....((((((((((.(((((((((((((.(((.((((((((((.(((................((((.((((....(((.(((((((((...)))))...)))).)))....)))).)))).(((((..((((..((((((((......(((((..(((((.((.(((..(..(((......(.((((((((((((........))))))...)))))))......)))..)..))).))...)).))).)))))((((((((.((((...(((..(((((...))))))))....((....)).....)))).))))))))..(((.((((((((((((((((.((((......))))..)))))........((((.(((.(((...((((((............))))))...)))..((((((((.....(((((((((((...(((((....(((.(((.((...((((((((.......((((....))))..((.((((.(((((....))))).)))).)).((((............((((((((((((....))))...)))))))))))))))))))).)).)))...)))..))))).)))))))))))(((((...))))).))))))))...))).)))).(((((((.(((((((((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).))))......(((((.(.(((...((((((((.((((..((((.....))))..))))..))(((((((..((((...))))..))))))).(((((......)))))((.......))...)))))))))).)))))..((((.(((((((((......((((((..((......))..))))))((((((((((((..(((((....))))).......((((((.(.(((((((((((....(((((((...........))))))))))))).))))).)))))))))))))))))))....)))))))))))))..))))))))))))))....(((((((((((((((((((.(((((((((((((.....)))...)))))..))))))))).))))....(((((((.......))).))))..))))))))))).((.(((.....))).)).........)))))))))))))))))))))))))).))))))))))))...)))))))))..((((((..((((.(((((...)))))))))..))))))(((((((.(((.((((((..(....)..))))))...))))))))))....(((......))).......))))).)).)))).))...)))))))..))).....((.((((..((((.(((((((((((......)))).))))))))))))))).))))))))).)))..)))......))))))))..))))))))).)))))(((....))).(((((((((((((((((...............((((....))))))))))...((((.....).)))....)))))))))))..)))))))))...(((((......................))))).....(((.((.....)).)))..........)))))))))..)))...))))).)).......))))))..)))))))..)))).))))..))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({(((({,..,,,,.,,,,((((((((((((.....((((((((.(((..,,,,((((((......)))))),,,|,||({..{{{{{{{{{{.,....,.,.{((((((((((..({{,{{{{{..,,,,,..(((((......))))).|}|}||||||((,{,...}}}}},)))|}{{{{....}}}}}})},.,))))))).)),.))}.,}))))...........,,,))})))))))))))))))))))))}}))|}}}}.,,..))}{{({(({(....}))).,|||{{..{{{,{,,,,,,{{{{{{{((((.{((...)))))))((((((.,...{{|,|||,..)))))),..}))}})),....((((....((..((((((((((...{,{.((..(((..((((((((((.((((..{({,,,{.((((((..,.{(((...)))|{....,,.(((((.(((((((....))))))).)))}),)))))).,}}....,,,,,.{((((.((.....)))))))..)))).)))}}))))))))).}))}..,,.))))))))))..)),,.}},}.........})))))}.|}},....,,..,||}},}}.{((({..(((((((((((((((..((((((...(((((((.{(((((((((((.((((........))))..((((((((((((.(((((.((,{((.(((((((.(.((...(((.((......(((......,,)}},.....))))).,..)))))))))).))))))))))..)))..(((((.((((......)))...}.))))).{((((.((((((((....{..(((.(.((((..(((..((((((((((....,,.((((((.....,}})))))....((((((((((.(((((((((((((.((,{((((((((((.((((({.{{{,,,,....,|||,.,||{,,..|||}{{{,(((((...)))))}..,}}..,||,.(((((....))))),,})}((({.,((((((((......(((((..(((((.(,.{({,,{,.(({......{.((((((({{(((..{{....,,))))}}}))))))|......}}}..,..})},)},},)).))).)))))((((((((.((((...(((..{((((...})))))))....||....)}.....)))).))))))))..(((.(((((((((((,{{,{.{{(({{,{{{||,,.,|||,,.,,,,||.{{((,(({.(((,,.((((((............)))))).,{||},,((((((((.,,,,(((((((((((...(((((.{..(((.(((.((...((((((((..,....{((({.{{||||...({((((.(,,,,...}))))).))))}),...,|,,.,|.......((((((((({{{....,)},..))))))))),.).)))))))).)).)))...))).}))))).))))))))))){||||...|}}}}.,)))))}}...}}}.}))}.{{((((|,(({(((|((((.((((((((((.........((((.((....)).))))........))))).))))).))))..,,,||{{||,|.{{||..((((((,{.((((..((((,...,))))..))))..,,(((((((,{(({....}))),,))))))).{((((......))))}((.......))...))))))))}}.)))))}}({((.(((((((((......((((((..((......))..))))))((((((((((((,.(((((....))))).,.....((((({,(.(((((((((((,{{...(((((....,}},)..}.))))})))))),})))).)))))))))))))))))))....))))))))))))).,})))))))))))))....(((((((((((((((((((.((((((((((,{.{{....)).,.)))))..)))))))))}})))..,.(((((((.......))).)))),.))))))))))).||.|||....,))).},.,.....,.))))))))))))))))))))))))))..))))}))))))...)))))))))..{(((((..((((.(((((...)))))))))..)))))}(((((((.(((.((((((..(....)..))))}),..))))))))))....{{(,,....})),......))))},)).)))).))...))))))}..))).....((.((({.,((((.(((((((.,,({{....)))).))))))))))))))).))))))))).)))..)))......))))})))..,)))))))).))))|(((....))),(((((((((((((((((...............((((....))))))))))...((({.....}.,})....)))))))))))..)))))))))...(((((..,.........,,.....,..))))).....(({.((.....)).})).,........))))))))),,)}}...))))).)).......))))))..)))))))..)))).))))})))).)
Forensic Context

No forensic context available.