Basic Information

Symbol
hsa_OGDH_0009400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-OGDH_0076
Host gene
OGDH
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
7:44741578-44744404 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:44701979-44704805 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1157.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1202.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 568.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((.(((((((.(((((((((..((((((((((.((.......((((((((((((((((((((((.(((.((((...((((((...(((((((((.((((((((..((.((((...(((((((((.(((..(((((..(((.....((((.....((.(((((....)))))))...(((((.((((((((.(((((((((............((((...(((.((.....)).)))..)))).....((((((..((.(((((.....)))))))))))))))))))))).)))))).........(((..(.(((...))).)..)))..(((.(((((................))))).))))).))))))))).....)))..)))))(((....)))...(((((.(((......)).).)))))...(((((.((((.(((((((...(((.....((((.....((((.....))))....)))))))....))))))).))))..))).))..))))))))..))))...)))).)).((((((((........)))))))).........)))))))).))).............................))))))...))))))...))))))).)))))))))))))))))))))).......)).))))))))))..))))))))).))))))).)).))))))(..(((.(((((((..((((((.(((..(((........((((((((((((.((((.....((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((.((((((.(.((.((((.((..(((((((((((((((((..((((((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..((...(((((((...(((..((((((((...............))))))))..))).........((((.(((......)).).))))...........((((((......(((((.(((.((((((((((....(((((............)))))....))))))))))(((.......)))))).))))).((((((....)))))).))))))..............)))))))....))..))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).))))))..)))))))))..))))))))..)).)))).)).).)))))).)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))..))).))))))..))))))).)))((((.......)))).....((((((((((((((((((((((((((((((((((...((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((..(((((((((((((.(((((..((((((((((.(((..(((..((((((.(((.((.((((((((...............((((......))))....................((((((((((.((((((((.((((....(((((.(((((((((....)))))((((.....)))).((.((((...((((.(.((.(((((((.((((....)).))))))))).))).))))))))..))(((((...))))).....................))))..))))))))))))).))))))....))))))))(((((....))))).((((.......))))......((((((((.(((.(((((........)))))))).)))).))))(((((((.(((((((((.((...((((((((..((((((((((((((((((....((((....((((.(((((((((......((..(((((((((((....))))))....))))).))....(((((((((((.(((....)))...)))))....))))))))))))))).))))......)))).......))))).)))))(((........)))(((((((((((((((.......)))))))))))))))(((((((((((((((....((((....(((((((((...(((((((((.((((......((..((((((((..............))))))))..))..(((((((..............))))))).........))))))))))))).....))))))))).))))..(((((....))))).(((((((((....(((((((........))))))).....))))))...))))))))))))))))))...(((((((..........)))))))....))))))))..))))).))))).)))).))))).))))))).)))))))).)).))).))))))..)))..))).))))))))))))))).)))))))))))))..))))))))))..)))))))))))))........(((((.....(((((.((.((((.......((((...((((((....(((((.((((.((((.........)))))))))))))....))...........(((((...)))))....))))..)))).......)))).))..)))))......)))))......)))))))))))))...))))))))).....))))))))))))))))))))).))))))))).))))))...)))))))))))))))))))))))))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,,,,.{{.(((((((.(((((((((..((((((((((.((.......((((((((((((((((((((((.((,{((((.,.((((((.,.(((((({((,((((((((,,((.((({...(((((((((.(((..(((((,.,......,{{((,,...{(.(((((....)))))}|{{|||{||||||{((((.(((((((((...,{{{.....((,{...,||.|,}}},.,,.,,,..}}}}.....((((((..((.(((((.....)))))))))))))))))))))).)))))),,.,..,|}|||..{.{|{...}|,.,..,))..{((,(((((................)))}},|||,{,|,}})}}...|{{{|||{.,,,,)}},.,}})))},}|||||}}|,......}|,|.,..},...(((((.((((.(((((((...(((.....((((.....,(((....}))}}....)))))))....))))))).))))..))).))..}))))))}..))))...)))).)).||((((((........))))))},.........)))))))}.,},,,.........,,..........,...,.}))))).,.)))))).,.))))))).)))))))))))))))))))))).......)).))))))))))..))))))))).))))))).||.||||||(..(((.(((((((..((((((.(((..{{{.,{,,..|((((((((((((.((((({,...,{(((((((((((((((((((((((((((((((.((((.((((((.{.((.((((.((..(((((((((((((((((..((((((.((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((..((...(((((((...{{{..{(((((((...............}))))))}..|||,......,,{{{,.,{({,.,{{||.}.}))))......,,}},{|||{......(((({.(((.((((((((((.,..(((((..........,.)))))....)))))))))){{{.......})}))).})))}.((((({....)))))).))))}},.............)))))))....))..))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))).))))))..)))))))))..))))))))..)).)))).)).}.)))))).)))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))}},,))).))))))..))))))).)))..|}}}}}}.}),,,..,|.((((((((((((((((((((((((((((((((((.,.((((({.(((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((({,((((((((((((((((((((((((((.((.((((((((..(((((((((((((.(((((,.{(((((((((.{((,,(({..(({{{(,(({.({.{{{|{|||,||.||},,|.....((((......))))....................((((((((.({((((,,,,.||||.,,..{|||}||||(((((....))))){{((,,,.,||}||{{{.((({(((({(,(.((.(((((((.((({....)).))))))))).,)){||||||||{{{{((((,{{{|||||,,{{{{{,,............||||.||||||||||},,,.)))).,...}))),)))),(((({{{{||((((((((.{{.{{,,,,{{,{{,,((((((((.(({,(((((........)))))))).)))).}|||{,,,|||,{,,,,,((({((,..((,((((,...,,,,.....||||,||{,,,,,,,,.,,,||(({((,,,,,||}}},}}||}},{({((((({{.,,.}}}})).,..))))}.,},}}}}|||||(({({.,,,,...,.,}..)))}}...,},|,,.}}}}))})}.,},,.....})),)}}}))},)))))}})))))}}.........,|(((((((((((((((.......)))))))))))))))|((((((((((((((....{{{,....(((((((((...(((((((((,(({{......((..((((((((..............))))))))..))..((((((,....,{{.......})))))).........})))))))))))).....))))))))).,}}}..,{{{{....,}}},.||{{(((((.,,.(((((((........))))))).,}..))))))...,,,))))))))))))))}...,,{((((..........})))})),,.,))))))))..))))).))))}}))}}.)))))}))))))).})))))}},)),))),}))))).,))},,))).))))))))))))))).)))))))))))))..))))))))))..)))))))))))))........(((((..,,,((({(,,,..((({,....,||||....((({,...,,....}}}},((((((((((.....,.(((({,{{,{,...((((.........(((((...)))))))))...,,)))))))..))))))))))..}}}.,.)).,})))),.})))))))))))))))))}},}}))))))).....))))))))))))))))))))).))))))))).})))))...)))))))))))))))))))))))))))))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.