Basic Information

Symbol
hsa_PABPN1_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PABPN1_0014
Host gene
PABPN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:23790809-23794479 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:23321600-23325270 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-286.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -299.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 190.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((.((((..((((.(((..(((.(((........))).))).(((.(....).)))))).))))...))))))))).(.(((..(((..(((((((((((((..(((((((.((((((((((...))))))).(((((....))))).(((((.....((((...(((((.(((((((((.(..((((..(((((.(.((((.(((((.....(((.((.((.((.(((.....))))).)))).))).))))).)......(((((...(((.......((((........))))........(((((..(((((.((((.((((......))))...))))(((((((((((((..((.(((((((((((....)))...))))))).).))..))..)))))).)))))....((((......))))...)))))..)))))(((((((((((.((((((.((((....)))).)).))))..........((...(((...)))...)).......((((((((((((.....)))..)))))))))...(.(((((.(((..((((((......)))..)))..)))))))).).........))))).)))).)).))).))))).........((((.((......)).))))...)))).)))))..))))..).))..))).)))))))))...))))....))))).........))))))))))..)))).....)))))))))...).))..).)).).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((.((((..((((.(((..(((.(((........))).))}.(({.{..,,).)))))).))))...))))))))).(.(((..(((..(((((((((((((..(((((((.((((((((((...))))))).,((((....))))}.(((((...,{(({{.{,(((({{(((((((,,.,..((((..(((((.(.(((,.(({((...,.(((.{{{((.(,,(((.....))))).)))}.))}.}})}).|,....{(((,...}|||...,,,{((,{.....,{{||,|.{{..({........}}..))||||}|(((......)))}|{,|||,{{({{{((((((,..{{.,{|||||{(((,,,,|||.,,}}||||}.|,||..|}..))}))).}))))},..|{{{....,.})}},.|)))).,,))}.((((((((((((.((({{{.{(((,,,.}}}}.)},)))).....,.,,{((.,.(((...)))...)}.,.,...((((((((((((.....)))..)))))))))..,(,(((((.({(..(({(((......)))..)))..}))))))}.,.........))))),,))).)))))),))))).......,,||||{{||,....})})))},..)))).)))))..))))..).,,..))).)))))))))}..))))....))))).........))))))))))..)))).....)))))))))...).))..).)).).
Forensic Context

No forensic context available.