Basic Information

Symbol
hsa_PABPN1_0000600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PABPN1_0005
Host gene
PABPN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
14:23791433-23793643 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
14:23322224-23324434 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-197.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -206.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((....((.(((.((....(((((((((.(((((....((((((...((((.((((......))))...)))).))))))(((((........))))).(((....)))...(((((((((.(((((..(((((((...(((((...(((....(((((...))))).......((((((((((((.((((((.((((....)))).)).))))..........((...(((...)))...)).......((((((((((((.....)))..)))))))))...(.(((((.(((..((((((......)))..)))..)))))))).).........))))).)))).))).((....))...........((((((.....)))))))))...))))).(((((((..........(((....)))............))))))).....((.((((....))))))))))))).))))).)))))))))))))).)))).......)))))...))))).))....))))).(((((........)))))............((((........))))...))))...((((.((.(((((....)))))..)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((((({...{{,|||.(({,..((((,((,({(((((,,,.((((((.,.((((.((((......))))...)))),)))))|(((((...,....|}}|||(((....)))...{((((((((.(((((..{(((({(..,{{(((..{{((....,,|||},,||}}}..,}}}.((((((((((((.(({{{{.{(((,,,,}}}}.)},)))).......,,{((.{.(((...))).,,}}.,.....((((((((((((.....)))..)))))))))..,(,(((((.({(..(({(((......)))..)))..}})))))}.}.........))))),,))).)))}||}}},}}.........,{((((({....,|}}|}|{|...,||}},.|{(((((..........(((....)))............)))))},.....}},))}},||||||||||}}}}}|,|}}}|,|}|||}|||}},})})))).,,,...))))}.,,))))),)),..,)))))}|||||,,,}....||||,.....}}}}...((((........))))...))))...((((.((.(((((....)))))..)).))))
Forensic Context

No forensic context available.