ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_chr5_0159700
Basic Information
Symbol
hsa_chr5_0159700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAIP2_0027
Host gene
PAIP2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
5:138683643-138684294
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:139347954-139348605
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-331.10
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-339.62
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
105.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((......))(.((((.(((((((.(((((((...(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.....((((((((((.((((((((..(.((((.((((((.((((((((((.((.(..((.(.(((....))).).))..)))(((((((((((.(((((((.(.((((((....((..(((((((....(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((....((((((((((((((..((.((((((....(((((........))))).)))))).))))))).)))))))))(((((((.((((((((((.((.........))))))))((((......)))).........)).)))))))))............................................))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))....)))))))..))....)))))).).))))))).))))))))))))))))))))).)))))).)))).)..)))))))).......)))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))...))))))).))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((......))(.((((.(((((((.(((((((.,.(((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((.....((((((((((,((((((((..(.((((.((((((.(((((((((((((((((,((((.......|||,}{{{..{{{((((((((({{.{{({(((,,.|,{{||}}..||..(((((((....(((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((({{{.((((((((({,(((,{((.((((((....(((((........))))).)))))).)}}))))}))))))))){(((({(.(({(((((((.((.........))))))))||||}.}}}}|||||.....,..,,,}}))))))}..................................,,,..,})}}))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))....))))))),,))....))))))})})),})))}))),))))))))))))))))).)))))).)))).)..)))))))).,.....)))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))).,.))))))).))))))}.)))))
Forensic Context
No forensic context available.