Basic Information

Symbol
hsa_PAIP2_0001200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAIP2_0011
Host gene
PAIP2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
5:138688239-138688742 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:139352550-139353053 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-354.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -359.35 kcal/mol
Frequency: 0.0004
Diversity: 29.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.