Basic Information

Symbol
hsa_MATR3_0009200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PAIP2_0008
Host gene
PAIP2
Type of circRNA
Intron-Intergenic
Location (GRCh37)
5:138660790-138682025 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:139325101-139346336 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-146.22 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -147.15 kcal/mol
Frequency: 0.2204
Diversity: 4.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)(.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((.(((((((.(((((((((((.((((((((((((((((....................................................................)))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....,........)(.(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.((.(((((((.(((((((((((.((((((((((((((((....................................................................)))))))))))))))).)))))))))))))))))).)).)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))).)
Forensic Context

No forensic context available.